Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX13Q9Y5W8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX13Q9Y5W8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX13Q9Y5W8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX13Q9Y5W8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX13Q9Y5W8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX13Q9Y5W8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX13Q9Y5W8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX13Q9Y5W8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX13Q9Y5W8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX13Q9Y5W8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX13Q9Y5W8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX13Q9Y5W8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX13Q9Y5W8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX13Q9Y5W8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX13Q9Y5W8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX13Q9Y5W8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX13Q9Y5W8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX13Q9Y5W8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX13Q9Y5W8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX13Q9Y5W8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX13Q9Y5W8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX13Q9Y5W8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX13Q9Y5W8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX13Q9Y5W8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX13Q9Y5W8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX13Q9Y5W8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX13Q9Y5W8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX13Q9Y5W8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX13Q9Y5W8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX13Q9Y5W8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX13Q9Y5W8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX13Q9Y5W8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX13Q9Y5W8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX13Q9Y5W8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX13Q9Y5W8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX13Q9Y5W8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX13Q9Y5W8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX13Q9Y5W8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX13Q9Y5W8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX13Q9Y5W8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX13Q9Y5W8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX13Q9Y5W8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX13Q9Y5W8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX13Q9Y5W8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX13Q9Y5W8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX13Q9Y5W8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX13Q9Y5W8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX13Q9Y5W8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX13Q9Y5W8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX13Q9Y5W8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX13Q9Y5W8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX13Q9Y5W8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX13Q9Y5W8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX13Q9Y5W8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX13Q9Y5W8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX13Q9Y5W8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX13Q9Y5W8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX13Q9Y5W8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX13Q9Y5W8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX13Q9Y5W8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX13Q9Y5W8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX13Q9Y5W8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX13Q9Y5W8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX13Q9Y5W8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX13Q9Y5W8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX13Q9Y5W8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX13Q9Y5W8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX13Q9Y5W8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX13Q9Y5W8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX13Q9Y5W8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX13Q9Y5W8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX13Q9Y5W8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX13Q9Y5W8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX13Q9Y5W8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX13Q9Y5W8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX13Q9Y5W8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX13Q9Y5W8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX13Q9Y5W8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX13Q9Y5W8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX13Q9Y5W8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX13Q9Y5W8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX13Q9Y5W8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX13Q9Y5W8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX13Q9Y5W8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX13Q9Y5W8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX13Q9Y5W8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX13Q9Y5W8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX13Q9Y5W8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX13Q9Y5W8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX13Q9Y5W8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX13Q9Y5W8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX13Q9Y5W8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX13Q9Y5W8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX13Q9Y5W8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX13Q9Y5W8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX13Q9Y5W8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX13Q9Y5W8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX13Q9Y5W8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms