Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC42Q9Y546 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC42Q9Y546 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC42Q9Y546 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC42Q9Y546 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC42Q9Y546 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC42Q9Y546 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC42Q9Y546 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC42Q9Y546 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC42Q9Y546 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC42Q9Y546 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC42Q9Y546 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC42Q9Y546 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC42Q9Y546 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC42Q9Y546 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC42Q9Y546 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC42Q9Y546 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC42Q9Y546 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC42Q9Y546 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC42Q9Y546 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC42Q9Y546 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC42Q9Y546 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC42Q9Y546 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC42Q9Y546 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC42Q9Y546 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC42Q9Y546 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC42Q9Y546 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC42Q9Y546 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC42Q9Y546 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC42Q9Y546 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC42Q9Y546 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC42Q9Y546 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC42Q9Y546 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC42Q9Y546 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC42Q9Y546 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC42Q9Y546 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC42Q9Y546 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC42Q9Y546 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC42Q9Y546 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC42Q9Y546 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC42Q9Y546 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC42Q9Y546 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC42Q9Y546 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC42Q9Y546 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC42Q9Y546 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC42Q9Y546 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC42Q9Y546 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC42Q9Y546 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC42Q9Y546 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC42Q9Y546 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC42Q9Y546 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC42Q9Y546 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC42Q9Y546 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC42Q9Y546 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC42Q9Y546 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC42Q9Y546 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC42Q9Y546 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC42Q9Y546 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC42Q9Y546 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC42Q9Y546 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC42Q9Y546 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC42Q9Y546 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC42Q9Y546 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC42Q9Y546 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC42Q9Y546 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC42Q9Y546 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC42Q9Y546 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC42Q9Y546 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC42Q9Y546 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC42Q9Y546 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC42Q9Y546 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC42Q9Y546 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC42Q9Y546 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC42Q9Y546 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC42Q9Y546 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC42Q9Y546 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC42Q9Y546 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms