Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP24Q9UPU5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP24Q9UPU5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP24Q9UPU5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP24Q9UPU5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP24Q9UPU5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP24Q9UPU5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP24Q9UPU5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP24Q9UPU5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP24Q9UPU5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP24Q9UPU5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP24Q9UPU5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP24Q9UPU5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP24Q9UPU5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP24Q9UPU5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP24Q9UPU5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP24Q9UPU5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP24Q9UPU5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP24Q9UPU5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP24Q9UPU5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP24Q9UPU5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP24Q9UPU5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP24Q9UPU5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP24Q9UPU5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP24Q9UPU5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP24Q9UPU5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP24Q9UPU5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP24Q9UPU5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP24Q9UPU5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP24Q9UPU5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP24Q9UPU5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP24Q9UPU5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP24Q9UPU5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP24Q9UPU5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP24Q9UPU5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP24Q9UPU5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP24Q9UPU5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP24Q9UPU5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP24Q9UPU5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP24Q9UPU5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP24Q9UPU5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP24Q9UPU5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP24Q9UPU5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP24Q9UPU5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP24Q9UPU5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP24Q9UPU5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP24Q9UPU5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP24Q9UPU5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP24Q9UPU5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP24Q9UPU5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP24Q9UPU5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP24Q9UPU5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP24Q9UPU5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP24Q9UPU5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP24Q9UPU5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP24Q9UPU5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP24Q9UPU5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP24Q9UPU5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP24Q9UPU5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP24Q9UPU5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP24Q9UPU5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP24Q9UPU5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP24Q9UPU5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP24Q9UPU5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP24Q9UPU5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP24Q9UPU5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP24Q9UPU5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP24Q9UPU5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP24Q9UPU5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP24Q9UPU5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP24Q9UPU5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP24Q9UPU5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP24Q9UPU5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP24Q9UPU5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP24Q9UPU5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP24Q9UPU5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP24Q9UPU5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP24Q9UPU5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP24Q9UPU5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP24Q9UPU5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP24Q9UPU5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP24Q9UPU5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP24Q9UPU5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP24Q9UPU5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP24Q9UPU5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP24Q9UPU5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP24Q9UPU5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP24Q9UPU5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP24Q9UPU5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP24Q9UPU5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP24Q9UPU5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP24Q9UPU5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP24Q9UPU5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP24Q9UPU5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP24Q9UPU5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP24Q9UPU5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP24Q9UPU5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP24Q9UPU5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP24Q9UPU5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP24Q9UPU5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms