Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRQQ9UMZ3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRQQ9UMZ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRQQ9UMZ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRQQ9UMZ3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRQQ9UMZ3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRQQ9UMZ3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRQQ9UMZ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRQQ9UMZ3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRQQ9UMZ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRQQ9UMZ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRQQ9UMZ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRQQ9UMZ3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRQQ9UMZ3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRQQ9UMZ3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRQQ9UMZ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRQQ9UMZ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRQQ9UMZ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRQQ9UMZ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRQQ9UMZ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRQQ9UMZ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRQQ9UMZ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRQQ9UMZ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRQQ9UMZ3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRQQ9UMZ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRQQ9UMZ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRQQ9UMZ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRQQ9UMZ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRQQ9UMZ3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRQQ9UMZ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRQQ9UMZ3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRQQ9UMZ3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRQQ9UMZ3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRQQ9UMZ3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRQQ9UMZ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRQQ9UMZ3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRQQ9UMZ3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRQQ9UMZ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRQQ9UMZ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRQQ9UMZ3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRQQ9UMZ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRQQ9UMZ3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRQQ9UMZ3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRQQ9UMZ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRQQ9UMZ3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRQQ9UMZ3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRQQ9UMZ3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRQQ9UMZ3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRQQ9UMZ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRQQ9UMZ3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRQQ9UMZ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRQQ9UMZ3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRQQ9UMZ3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRQQ9UMZ3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRQQ9UMZ3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRQQ9UMZ3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRQQ9UMZ3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRQQ9UMZ3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRQQ9UMZ3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRQQ9UMZ3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRQQ9UMZ3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRQQ9UMZ3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRQQ9UMZ3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRQQ9UMZ3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRQQ9UMZ3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRQQ9UMZ3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRQQ9UMZ3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRQQ9UMZ3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRQQ9UMZ3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRQQ9UMZ3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRQQ9UMZ3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRQQ9UMZ3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRQQ9UMZ3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRQQ9UMZ3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRQQ9UMZ3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRQQ9UMZ3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRQQ9UMZ3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRQQ9UMZ3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRQQ9UMZ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRQQ9UMZ3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRQQ9UMZ3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRQQ9UMZ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRQQ9UMZ3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRQQ9UMZ3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRQQ9UMZ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRQQ9UMZ3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRQQ9UMZ3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRQQ9UMZ3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRQQ9UMZ3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRQQ9UMZ3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRQQ9UMZ3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRQQ9UMZ3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRQQ9UMZ3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRQQ9UMZ3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRQQ9UMZ3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRQQ9UMZ3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRQQ9UMZ3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRQQ9UMZ3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRQQ9UMZ3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms