Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ3

GPATCH8, G patch domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH8Q9UKJ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
GPATCH8Q9UKJ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
GPATCH8Q9UKJ3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.85■■■■■ 4.13
GPATCH8Q9UKJ3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
GPATCH8Q9UKJ3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
GPATCH8Q9UKJ3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
GPATCH8Q9UKJ3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
GPATCH8Q9UKJ3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
GPATCH8Q9UKJ3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
GPATCH8Q9UKJ3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
GPATCH8Q9UKJ3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
GPATCH8Q9UKJ3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
GPATCH8Q9UKJ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
GPATCH8Q9UKJ3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
GPATCH8Q9UKJ3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
GPATCH8Q9UKJ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
GPATCH8Q9UKJ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
GPATCH8Q9UKJ3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
GPATCH8Q9UKJ3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
GPATCH8Q9UKJ3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
GPATCH8Q9UKJ3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
GPATCH8Q9UKJ3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
GPATCH8Q9UKJ3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
GPATCH8Q9UKJ3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
GPATCH8Q9UKJ3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
GPATCH8Q9UKJ3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
GPATCH8Q9UKJ3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
GPATCH8Q9UKJ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
GPATCH8Q9UKJ3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
GPATCH8Q9UKJ3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
GPATCH8Q9UKJ3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
GPATCH8Q9UKJ3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
GPATCH8Q9UKJ3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
GPATCH8Q9UKJ3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
GPATCH8Q9UKJ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
GPATCH8Q9UKJ3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
GPATCH8Q9UKJ3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
GPATCH8Q9UKJ3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
GPATCH8Q9UKJ3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
GPATCH8Q9UKJ3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
GPATCH8Q9UKJ3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
GPATCH8Q9UKJ3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
GPATCH8Q9UKJ3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
GPATCH8Q9UKJ3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
GPATCH8Q9UKJ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
GPATCH8Q9UKJ3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
GPATCH8Q9UKJ3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
GPATCH8Q9UKJ3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
GPATCH8Q9UKJ3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
GPATCH8Q9UKJ3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
GPATCH8Q9UKJ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
GPATCH8Q9UKJ3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
GPATCH8Q9UKJ3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
GPATCH8Q9UKJ3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
GPATCH8Q9UKJ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
GPATCH8Q9UKJ3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
GPATCH8Q9UKJ3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
GPATCH8Q9UKJ3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
GPATCH8Q9UKJ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
GPATCH8Q9UKJ3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
GPATCH8Q9UKJ3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
GPATCH8Q9UKJ3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
GPATCH8Q9UKJ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
GPATCH8Q9UKJ3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
GPATCH8Q9UKJ3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
GPATCH8Q9UKJ3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
GPATCH8Q9UKJ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
GPATCH8Q9UKJ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
GPATCH8Q9UKJ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
GPATCH8Q9UKJ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
GPATCH8Q9UKJ3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
GPATCH8Q9UKJ3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
GPATCH8Q9UKJ3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
GPATCH8Q9UKJ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
GPATCH8Q9UKJ3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC40.45■■■■■ 4.07
GPATCH8Q9UKJ3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
GPATCH8Q9UKJ3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
GPATCH8Q9UKJ3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
GPATCH8Q9UKJ3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
GPATCH8Q9UKJ3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
GPATCH8Q9UKJ3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
GPATCH8Q9UKJ3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
GPATCH8Q9UKJ3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
GPATCH8Q9UKJ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
GPATCH8Q9UKJ3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
GPATCH8Q9UKJ3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
GPATCH8Q9UKJ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
GPATCH8Q9UKJ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
GPATCH8Q9UKJ3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
GPATCH8Q9UKJ3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
GPATCH8Q9UKJ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
GPATCH8Q9UKJ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
GPATCH8Q9UKJ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
GPATCH8Q9UKJ3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
GPATCH8Q9UKJ3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
GPATCH8Q9UKJ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
GPATCH8Q9UKJ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
GPATCH8Q9UKJ3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms