Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHF11Q9UIL8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF11Q9UIL8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF11Q9UIL8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF11Q9UIL8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF11Q9UIL8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF11Q9UIL8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF11Q9UIL8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF11Q9UIL8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF11Q9UIL8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF11Q9UIL8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF11Q9UIL8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF11Q9UIL8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF11Q9UIL8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF11Q9UIL8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF11Q9UIL8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF11Q9UIL8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF11Q9UIL8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF11Q9UIL8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF11Q9UIL8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF11Q9UIL8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF11Q9UIL8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF11Q9UIL8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF11Q9UIL8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF11Q9UIL8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF11Q9UIL8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF11Q9UIL8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF11Q9UIL8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF11Q9UIL8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF11Q9UIL8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF11Q9UIL8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF11Q9UIL8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF11Q9UIL8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF11Q9UIL8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF11Q9UIL8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF11Q9UIL8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF11Q9UIL8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF11Q9UIL8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF11Q9UIL8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF11Q9UIL8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF11Q9UIL8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF11Q9UIL8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF11Q9UIL8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF11Q9UIL8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF11Q9UIL8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHF11Q9UIL8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF11Q9UIL8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PHF11Q9UIL8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF11Q9UIL8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF11Q9UIL8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF11Q9UIL8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF11Q9UIL8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF11Q9UIL8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHF11Q9UIL8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF11Q9UIL8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF11Q9UIL8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms