Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2L0

WDR35, WD repeat-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR35Q9P2L0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WDR35Q9P2L0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
WDR35Q9P2L0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
WDR35Q9P2L0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
WDR35Q9P2L0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
WDR35Q9P2L0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms