Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDP2Q9P2J9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDP2Q9P2J9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDP2Q9P2J9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDP2Q9P2J9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDP2Q9P2J9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDP2Q9P2J9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDP2Q9P2J9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDP2Q9P2J9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDP2Q9P2J9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDP2Q9P2J9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDP2Q9P2J9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDP2Q9P2J9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDP2Q9P2J9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDP2Q9P2J9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDP2Q9P2J9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDP2Q9P2J9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDP2Q9P2J9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDP2Q9P2J9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDP2Q9P2J9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDP2Q9P2J9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDP2Q9P2J9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDP2Q9P2J9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDP2Q9P2J9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDP2Q9P2J9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDP2Q9P2J9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDP2Q9P2J9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDP2Q9P2J9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDP2Q9P2J9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDP2Q9P2J9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDP2Q9P2J9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDP2Q9P2J9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDP2Q9P2J9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDP2Q9P2J9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDP2Q9P2J9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDP2Q9P2J9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDP2Q9P2J9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDP2Q9P2J9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDP2Q9P2J9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDP2Q9P2J9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDP2Q9P2J9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDP2Q9P2J9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDP2Q9P2J9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDP2Q9P2J9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDP2Q9P2J9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDP2Q9P2J9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms