Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHD7Q9P2D1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHD7Q9P2D1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHD7Q9P2D1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHD7Q9P2D1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CHD7Q9P2D1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHD7Q9P2D1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHD7Q9P2D1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHD7Q9P2D1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHD7Q9P2D1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHD7Q9P2D1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHD7Q9P2D1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHD7Q9P2D1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CHD7Q9P2D1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHD7Q9P2D1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHD7Q9P2D1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHD7Q9P2D1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHD7Q9P2D1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHD7Q9P2D1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHD7Q9P2D1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHD7Q9P2D1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHD7Q9P2D1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHD7Q9P2D1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHD7Q9P2D1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHD7Q9P2D1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHD7Q9P2D1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CHD7Q9P2D1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHD7Q9P2D1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHD7Q9P2D1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHD7Q9P2D1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHD7Q9P2D1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHD7Q9P2D1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHD7Q9P2D1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHD7Q9P2D1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHD7Q9P2D1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHD7Q9P2D1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHD7Q9P2D1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHD7Q9P2D1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHD7Q9P2D1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHD7Q9P2D1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHD7Q9P2D1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHD7Q9P2D1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHD7Q9P2D1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHD7Q9P2D1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHD7Q9P2D1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHD7Q9P2D1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHD7Q9P2D1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHD7Q9P2D1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHD7Q9P2D1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHD7Q9P2D1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHD7Q9P2D1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHD7Q9P2D1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHD7Q9P2D1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHD7Q9P2D1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CHD7Q9P2D1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHD7Q9P2D1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHD7Q9P2D1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHD7Q9P2D1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHD7Q9P2D1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHD7Q9P2D1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHD7Q9P2D1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHD7Q9P2D1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHD7Q9P2D1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHD7Q9P2D1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHD7Q9P2D1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHD7Q9P2D1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHD7Q9P2D1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHD7Q9P2D1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHD7Q9P2D1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHD7Q9P2D1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHD7Q9P2D1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHD7Q9P2D1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHD7Q9P2D1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHD7Q9P2D1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHD7Q9P2D1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHD7Q9P2D1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHD7Q9P2D1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHD7Q9P2D1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHD7Q9P2D1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHD7Q9P2D1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHD7Q9P2D1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHD7Q9P2D1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHD7Q9P2D1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHD7Q9P2D1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHD7Q9P2D1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHD7Q9P2D1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHD7Q9P2D1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHD7Q9P2D1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHD7Q9P2D1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CHD7Q9P2D1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHD7Q9P2D1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHD7Q9P2D1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHD7Q9P2D1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHD7Q9P2D1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHD7Q9P2D1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHD7Q9P2D1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHD7Q9P2D1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHD7Q9P2D1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHD7Q9P2D1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHD7Q9P2D1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms