Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI6

TFCP2L1, Transcription factor CP2-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2L1Q9NZI6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TFCP2L1Q9NZI6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TFCP2L1Q9NZI6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TFCP2L1Q9NZI6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TFCP2L1Q9NZI6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TFCP2L1Q9NZI6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TFCP2L1Q9NZI6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TFCP2L1Q9NZI6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TFCP2L1Q9NZI6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TFCP2L1Q9NZI6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TFCP2L1Q9NZI6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TFCP2L1Q9NZI6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TFCP2L1Q9NZI6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TFCP2L1Q9NZI6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
TFCP2L1Q9NZI6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TFCP2L1Q9NZI6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TFCP2L1Q9NZI6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TFCP2L1Q9NZI6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TFCP2L1Q9NZI6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TFCP2L1Q9NZI6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TFCP2L1Q9NZI6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TFCP2L1Q9NZI6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TFCP2L1Q9NZI6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TFCP2L1Q9NZI6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TFCP2L1Q9NZI6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TFCP2L1Q9NZI6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TFCP2L1Q9NZI6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
TFCP2L1Q9NZI6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TFCP2L1Q9NZI6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TFCP2L1Q9NZI6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TFCP2L1Q9NZI6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TFCP2L1Q9NZI6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TFCP2L1Q9NZI6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TFCP2L1Q9NZI6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TFCP2L1Q9NZI6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TFCP2L1Q9NZI6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TFCP2L1Q9NZI6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TFCP2L1Q9NZI6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TFCP2L1Q9NZI6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TFCP2L1Q9NZI6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TFCP2L1Q9NZI6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TFCP2L1Q9NZI6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TFCP2L1Q9NZI6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TFCP2L1Q9NZI6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TFCP2L1Q9NZI6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TFCP2L1Q9NZI6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TFCP2L1Q9NZI6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TFCP2L1Q9NZI6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TFCP2L1Q9NZI6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TFCP2L1Q9NZI6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TFCP2L1Q9NZI6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TFCP2L1Q9NZI6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TFCP2L1Q9NZI6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TFCP2L1Q9NZI6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TFCP2L1Q9NZI6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TFCP2L1Q9NZI6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TFCP2L1Q9NZI6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TFCP2L1Q9NZI6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TFCP2L1Q9NZI6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TFCP2L1Q9NZI6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TFCP2L1Q9NZI6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TFCP2L1Q9NZI6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TFCP2L1Q9NZI6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
TFCP2L1Q9NZI6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
TFCP2L1Q9NZI6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TFCP2L1Q9NZI6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TFCP2L1Q9NZI6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TFCP2L1Q9NZI6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TFCP2L1Q9NZI6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TFCP2L1Q9NZI6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TFCP2L1Q9NZI6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TFCP2L1Q9NZI6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TFCP2L1Q9NZI6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TFCP2L1Q9NZI6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TFCP2L1Q9NZI6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TFCP2L1Q9NZI6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TFCP2L1Q9NZI6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TFCP2L1Q9NZI6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TFCP2L1Q9NZI6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TFCP2L1Q9NZI6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TFCP2L1Q9NZI6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TFCP2L1Q9NZI6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TFCP2L1Q9NZI6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.8■■■■□ 3
TFCP2L1Q9NZI6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
TFCP2L1Q9NZI6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TFCP2L1Q9NZI6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TFCP2L1Q9NZI6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
TFCP2L1Q9NZI6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TFCP2L1Q9NZI6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TFCP2L1Q9NZI6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TFCP2L1Q9NZI6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TFCP2L1Q9NZI6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TFCP2L1Q9NZI6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TFCP2L1Q9NZI6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TFCP2L1Q9NZI6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TFCP2L1Q9NZI6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TFCP2L1Q9NZI6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TFCP2L1Q9NZI6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TFCP2L1Q9NZI6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
TFCP2L1Q9NZI6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms