Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX0

PRDM6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM6Q9NQX0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRDM6Q9NQX0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRDM6Q9NQX0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM6Q9NQX0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM6Q9NQX0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM6Q9NQX0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM6Q9NQX0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM6Q9NQX0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM6Q9NQX0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM6Q9NQX0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRDM6Q9NQX0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM6Q9NQX0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM6Q9NQX0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM6Q9NQX0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM6Q9NQX0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM6Q9NQX0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM6Q9NQX0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM6Q9NQX0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM6Q9NQX0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM6Q9NQX0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM6Q9NQX0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM6Q9NQX0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM6Q9NQX0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM6Q9NQX0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM6Q9NQX0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM6Q9NQX0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM6Q9NQX0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM6Q9NQX0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM6Q9NQX0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM6Q9NQX0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM6Q9NQX0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM6Q9NQX0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM6Q9NQX0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM6Q9NQX0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM6Q9NQX0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM6Q9NQX0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM6Q9NQX0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM6Q9NQX0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM6Q9NQX0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM6Q9NQX0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM6Q9NQX0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM6Q9NQX0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM6Q9NQX0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM6Q9NQX0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM6Q9NQX0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM6Q9NQX0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM6Q9NQX0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM6Q9NQX0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM6Q9NQX0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM6Q9NQX0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM6Q9NQX0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM6Q9NQX0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM6Q9NQX0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM6Q9NQX0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM6Q9NQX0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM6Q9NQX0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM6Q9NQX0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM6Q9NQX0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM6Q9NQX0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM6Q9NQX0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM6Q9NQX0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM6Q9NQX0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM6Q9NQX0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM6Q9NQX0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM6Q9NQX0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM6Q9NQX0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM6Q9NQX0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM6Q9NQX0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM6Q9NQX0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM6Q9NQX0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM6Q9NQX0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM6Q9NQX0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM6Q9NQX0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM6Q9NQX0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM6Q9NQX0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM6Q9NQX0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM6Q9NQX0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM6Q9NQX0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM6Q9NQX0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM6Q9NQX0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM6Q9NQX0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM6Q9NQX0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM6Q9NQX0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM6Q9NQX0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM6Q9NQX0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM6Q9NQX0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM6Q9NQX0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM6Q9NQX0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM6Q9NQX0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM6Q9NQX0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM6Q9NQX0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM6Q9NQX0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRDM6Q9NQX0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM6Q9NQX0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM6Q9NQX0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM6Q9NQX0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM6Q9NQX0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDM6Q9NQX0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM6Q9NQX0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDM6Q9NQX0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms