Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FSCN3Q9NQT6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FSCN3Q9NQT6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FSCN3Q9NQT6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FSCN3Q9NQT6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FSCN3Q9NQT6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FSCN3Q9NQT6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FSCN3Q9NQT6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FSCN3Q9NQT6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FSCN3Q9NQT6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FSCN3Q9NQT6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FSCN3Q9NQT6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FSCN3Q9NQT6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FSCN3Q9NQT6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FSCN3Q9NQT6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FSCN3Q9NQT6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FSCN3Q9NQT6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FSCN3Q9NQT6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FSCN3Q9NQT6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FSCN3Q9NQT6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FSCN3Q9NQT6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FSCN3Q9NQT6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FSCN3Q9NQT6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FSCN3Q9NQT6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FSCN3Q9NQT6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FSCN3Q9NQT6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FSCN3Q9NQT6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FSCN3Q9NQT6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FSCN3Q9NQT6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FSCN3Q9NQT6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FSCN3Q9NQT6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FSCN3Q9NQT6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FSCN3Q9NQT6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FSCN3Q9NQT6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FSCN3Q9NQT6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FSCN3Q9NQT6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FSCN3Q9NQT6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FSCN3Q9NQT6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FSCN3Q9NQT6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FSCN3Q9NQT6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FSCN3Q9NQT6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FSCN3Q9NQT6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FSCN3Q9NQT6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FSCN3Q9NQT6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FSCN3Q9NQT6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FSCN3Q9NQT6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FSCN3Q9NQT6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FSCN3Q9NQT6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FSCN3Q9NQT6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FSCN3Q9NQT6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FSCN3Q9NQT6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FSCN3Q9NQT6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FSCN3Q9NQT6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FSCN3Q9NQT6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FSCN3Q9NQT6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FSCN3Q9NQT6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FSCN3Q9NQT6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FSCN3Q9NQT6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FSCN3Q9NQT6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FSCN3Q9NQT6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FSCN3Q9NQT6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FSCN3Q9NQT6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FSCN3Q9NQT6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FSCN3Q9NQT6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FSCN3Q9NQT6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FSCN3Q9NQT6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FSCN3Q9NQT6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FSCN3Q9NQT6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FSCN3Q9NQT6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FSCN3Q9NQT6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FSCN3Q9NQT6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FSCN3Q9NQT6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FSCN3Q9NQT6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FSCN3Q9NQT6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FSCN3Q9NQT6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms