Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TIMMDC1Q9NPL8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIMMDC1Q9NPL8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIMMDC1Q9NPL8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIMMDC1Q9NPL8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIMMDC1Q9NPL8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIMMDC1Q9NPL8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIMMDC1Q9NPL8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIMMDC1Q9NPL8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIMMDC1Q9NPL8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIMMDC1Q9NPL8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIMMDC1Q9NPL8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TIMMDC1Q9NPL8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIMMDC1Q9NPL8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIMMDC1Q9NPL8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIMMDC1Q9NPL8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIMMDC1Q9NPL8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIMMDC1Q9NPL8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIMMDC1Q9NPL8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIMMDC1Q9NPL8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIMMDC1Q9NPL8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIMMDC1Q9NPL8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMMDC1Q9NPL8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMMDC1Q9NPL8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMMDC1Q9NPL8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIMMDC1Q9NPL8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIMMDC1Q9NPL8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIMMDC1Q9NPL8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIMMDC1Q9NPL8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMMDC1Q9NPL8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMMDC1Q9NPL8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIMMDC1Q9NPL8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIMMDC1Q9NPL8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIMMDC1Q9NPL8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TIMMDC1Q9NPL8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIMMDC1Q9NPL8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TIMMDC1Q9NPL8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TIMMDC1Q9NPL8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TIMMDC1Q9NPL8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIMMDC1Q9NPL8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIMMDC1Q9NPL8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms