Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ1

MKKS, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKKSQ9NPJ1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKKSQ9NPJ1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MKKSQ9NPJ1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKKSQ9NPJ1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKKSQ9NPJ1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKKSQ9NPJ1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKKSQ9NPJ1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKKSQ9NPJ1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MKKSQ9NPJ1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKKSQ9NPJ1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKKSQ9NPJ1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKKSQ9NPJ1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKKSQ9NPJ1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKKSQ9NPJ1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKKSQ9NPJ1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKKSQ9NPJ1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKKSQ9NPJ1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKKSQ9NPJ1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKKSQ9NPJ1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKKSQ9NPJ1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKKSQ9NPJ1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKKSQ9NPJ1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKKSQ9NPJ1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKKSQ9NPJ1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKKSQ9NPJ1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKKSQ9NPJ1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKKSQ9NPJ1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKKSQ9NPJ1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKKSQ9NPJ1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MKKSQ9NPJ1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKKSQ9NPJ1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MKKSQ9NPJ1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKKSQ9NPJ1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKKSQ9NPJ1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKKSQ9NPJ1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKKSQ9NPJ1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKKSQ9NPJ1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKKSQ9NPJ1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKKSQ9NPJ1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKKSQ9NPJ1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MKKSQ9NPJ1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKKSQ9NPJ1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKKSQ9NPJ1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKKSQ9NPJ1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKKSQ9NPJ1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MKKSQ9NPJ1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKKSQ9NPJ1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKKSQ9NPJ1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKKSQ9NPJ1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKKSQ9NPJ1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKKSQ9NPJ1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKKSQ9NPJ1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKKSQ9NPJ1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKKSQ9NPJ1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKKSQ9NPJ1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKKSQ9NPJ1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKKSQ9NPJ1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MKKSQ9NPJ1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MKKSQ9NPJ1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKKSQ9NPJ1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKKSQ9NPJ1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKKSQ9NPJ1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKKSQ9NPJ1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKKSQ9NPJ1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKKSQ9NPJ1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKKSQ9NPJ1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKKSQ9NPJ1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKKSQ9NPJ1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKKSQ9NPJ1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKKSQ9NPJ1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKKSQ9NPJ1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKKSQ9NPJ1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKKSQ9NPJ1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKKSQ9NPJ1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKKSQ9NPJ1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKKSQ9NPJ1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKKSQ9NPJ1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKKSQ9NPJ1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKKSQ9NPJ1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKKSQ9NPJ1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKKSQ9NPJ1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKKSQ9NPJ1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKKSQ9NPJ1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKKSQ9NPJ1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKKSQ9NPJ1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKKSQ9NPJ1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKKSQ9NPJ1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKKSQ9NPJ1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKKSQ9NPJ1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MKKSQ9NPJ1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MKKSQ9NPJ1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKKSQ9NPJ1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MKKSQ9NPJ1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms