Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE3

NOP10, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP10Q9NPE3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NOP10Q9NPE3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NOP10Q9NPE3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NOP10Q9NPE3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NOP10Q9NPE3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NOP10Q9NPE3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NOP10Q9NPE3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NOP10Q9NPE3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOP10Q9NPE3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NOP10Q9NPE3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NOP10Q9NPE3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NOP10Q9NPE3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NOP10Q9NPE3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NOP10Q9NPE3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NOP10Q9NPE3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NOP10Q9NPE3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NOP10Q9NPE3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NOP10Q9NPE3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NOP10Q9NPE3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NOP10Q9NPE3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NOP10Q9NPE3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NOP10Q9NPE3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOP10Q9NPE3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOP10Q9NPE3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOP10Q9NPE3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOP10Q9NPE3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOP10Q9NPE3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NOP10Q9NPE3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NOP10Q9NPE3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NOP10Q9NPE3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NOP10Q9NPE3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NOP10Q9NPE3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NOP10Q9NPE3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NOP10Q9NPE3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NOP10Q9NPE3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NOP10Q9NPE3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NOP10Q9NPE3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NOP10Q9NPE3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NOP10Q9NPE3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NOP10Q9NPE3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NOP10Q9NPE3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NOP10Q9NPE3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOP10Q9NPE3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms