Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARFGAP3Q9NP61 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARFGAP3Q9NP61 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARFGAP3Q9NP61 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARFGAP3Q9NP61 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARFGAP3Q9NP61 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARFGAP3Q9NP61 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARFGAP3Q9NP61 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARFGAP3Q9NP61 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARFGAP3Q9NP61 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARFGAP3Q9NP61 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARFGAP3Q9NP61 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARFGAP3Q9NP61 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARFGAP3Q9NP61 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARFGAP3Q9NP61 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARFGAP3Q9NP61 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARFGAP3Q9NP61 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARFGAP3Q9NP61 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARFGAP3Q9NP61 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARFGAP3Q9NP61 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARFGAP3Q9NP61 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGAP3Q9NP61 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGAP3Q9NP61 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARFGAP3Q9NP61 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARFGAP3Q9NP61 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARFGAP3Q9NP61 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARFGAP3Q9NP61 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARFGAP3Q9NP61 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARFGAP3Q9NP61 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARFGAP3Q9NP61 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARFGAP3Q9NP61 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARFGAP3Q9NP61 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARFGAP3Q9NP61 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARFGAP3Q9NP61 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARFGAP3Q9NP61 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARFGAP3Q9NP61 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARFGAP3Q9NP61 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGAP3Q9NP61 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGAP3Q9NP61 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARFGAP3Q9NP61 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARFGAP3Q9NP61 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARFGAP3Q9NP61 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARFGAP3Q9NP61 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARFGAP3Q9NP61 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARFGAP3Q9NP61 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARFGAP3Q9NP61 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARFGAP3Q9NP61 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARFGAP3Q9NP61 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARFGAP3Q9NP61 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARFGAP3Q9NP61 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARFGAP3Q9NP61 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARFGAP3Q9NP61 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARFGAP3Q9NP61 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ARFGAP3Q9NP61 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARFGAP3Q9NP61 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARFGAP3Q9NP61 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARFGAP3Q9NP61 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARFGAP3Q9NP61 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARFGAP3Q9NP61 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
ARFGAP3Q9NP61 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARFGAP3Q9NP61 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARFGAP3Q9NP61 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARFGAP3Q9NP61 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARFGAP3Q9NP61 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARFGAP3Q9NP61 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ARFGAP3Q9NP61 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARFGAP3Q9NP61 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARFGAP3Q9NP61 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARFGAP3Q9NP61 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARFGAP3Q9NP61 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARFGAP3Q9NP61 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARFGAP3Q9NP61 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARFGAP3Q9NP61 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARFGAP3Q9NP61 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARFGAP3Q9NP61 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARFGAP3Q9NP61 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARFGAP3Q9NP61 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARFGAP3Q9NP61 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ARFGAP3Q9NP61 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARFGAP3Q9NP61 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ARFGAP3Q9NP61 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARFGAP3Q9NP61 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARFGAP3Q9NP61 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ARFGAP3Q9NP61 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ARFGAP3Q9NP61 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARFGAP3Q9NP61 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ARFGAP3Q9NP61 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARFGAP3Q9NP61 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARFGAP3Q9NP61 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ARFGAP3Q9NP61 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARFGAP3Q9NP61 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARFGAP3Q9NP61 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ARFGAP3Q9NP61 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARFGAP3Q9NP61 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARFGAP3Q9NP61 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARFGAP3Q9NP61 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms