Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRM3Q9NNZ6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRM3Q9NNZ6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRM3Q9NNZ6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRM3Q9NNZ6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRM3Q9NNZ6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRM3Q9NNZ6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRM3Q9NNZ6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRM3Q9NNZ6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRM3Q9NNZ6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRM3Q9NNZ6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRM3Q9NNZ6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRM3Q9NNZ6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRM3Q9NNZ6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRM3Q9NNZ6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRM3Q9NNZ6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRM3Q9NNZ6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRM3Q9NNZ6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRM3Q9NNZ6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRM3Q9NNZ6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRM3Q9NNZ6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRM3Q9NNZ6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRM3Q9NNZ6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRM3Q9NNZ6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRM3Q9NNZ6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRM3Q9NNZ6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRM3Q9NNZ6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRM3Q9NNZ6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRM3Q9NNZ6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRM3Q9NNZ6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRM3Q9NNZ6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRM3Q9NNZ6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRM3Q9NNZ6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRM3Q9NNZ6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRM3Q9NNZ6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRM3Q9NNZ6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRM3Q9NNZ6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRM3Q9NNZ6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRM3Q9NNZ6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRM3Q9NNZ6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRM3Q9NNZ6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRM3Q9NNZ6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRM3Q9NNZ6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRM3Q9NNZ6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRM3Q9NNZ6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRM3Q9NNZ6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRM3Q9NNZ6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRM3Q9NNZ6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRM3Q9NNZ6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRM3Q9NNZ6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRM3Q9NNZ6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRM3Q9NNZ6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRM3Q9NNZ6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRM3Q9NNZ6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRM3Q9NNZ6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRM3Q9NNZ6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRM3Q9NNZ6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRM3Q9NNZ6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRM3Q9NNZ6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRM3Q9NNZ6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRM3Q9NNZ6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRM3Q9NNZ6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRM3Q9NNZ6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRM3Q9NNZ6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRM3Q9NNZ6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRM3Q9NNZ6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRM3Q9NNZ6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRM3Q9NNZ6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRM3Q9NNZ6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRM3Q9NNZ6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRM3Q9NNZ6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRM3Q9NNZ6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRM3Q9NNZ6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRM3Q9NNZ6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRM3Q9NNZ6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRM3Q9NNZ6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRM3Q9NNZ6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms