Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCX3

ZNF304, Zinc finger protein 304, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF304Q9HCX3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF304Q9HCX3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF304Q9HCX3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF304Q9HCX3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF304Q9HCX3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF304Q9HCX3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF304Q9HCX3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF304Q9HCX3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF304Q9HCX3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF304Q9HCX3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF304Q9HCX3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF304Q9HCX3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF304Q9HCX3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF304Q9HCX3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF304Q9HCX3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF304Q9HCX3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF304Q9HCX3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF304Q9HCX3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF304Q9HCX3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF304Q9HCX3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF304Q9HCX3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF304Q9HCX3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF304Q9HCX3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF304Q9HCX3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF304Q9HCX3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF304Q9HCX3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF304Q9HCX3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF304Q9HCX3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF304Q9HCX3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF304Q9HCX3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF304Q9HCX3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF304Q9HCX3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF304Q9HCX3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF304Q9HCX3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF304Q9HCX3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF304Q9HCX3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF304Q9HCX3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF304Q9HCX3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF304Q9HCX3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF304Q9HCX3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF304Q9HCX3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF304Q9HCX3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF304Q9HCX3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF304Q9HCX3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF304Q9HCX3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF304Q9HCX3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF304Q9HCX3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF304Q9HCX3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF304Q9HCX3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF304Q9HCX3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF304Q9HCX3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF304Q9HCX3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF304Q9HCX3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF304Q9HCX3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF304Q9HCX3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF304Q9HCX3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF304Q9HCX3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF304Q9HCX3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF304Q9HCX3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF304Q9HCX3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF304Q9HCX3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF304Q9HCX3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF304Q9HCX3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF304Q9HCX3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF304Q9HCX3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF304Q9HCX3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF304Q9HCX3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF304Q9HCX3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF304Q9HCX3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF304Q9HCX3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF304Q9HCX3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF304Q9HCX3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF304Q9HCX3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF304Q9HCX3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF304Q9HCX3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF304Q9HCX3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF304Q9HCX3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF304Q9HCX3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF304Q9HCX3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF304Q9HCX3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF304Q9HCX3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF304Q9HCX3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF304Q9HCX3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF304Q9HCX3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF304Q9HCX3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF304Q9HCX3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF304Q9HCX3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF304Q9HCX3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF304Q9HCX3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF304Q9HCX3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF304Q9HCX3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF304Q9HCX3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF304Q9HCX3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF304Q9HCX3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF304Q9HCX3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF304Q9HCX3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF304Q9HCX3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF304Q9HCX3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF304Q9HCX3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF304Q9HCX3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms