Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EBF2Q9HAK2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EBF2Q9HAK2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EBF2Q9HAK2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EBF2Q9HAK2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EBF2Q9HAK2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EBF2Q9HAK2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EBF2Q9HAK2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
EBF2Q9HAK2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EBF2Q9HAK2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EBF2Q9HAK2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EBF2Q9HAK2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EBF2Q9HAK2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EBF2Q9HAK2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
EBF2Q9HAK2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EBF2Q9HAK2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EBF2Q9HAK2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EBF2Q9HAK2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EBF2Q9HAK2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EBF2Q9HAK2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EBF2Q9HAK2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EBF2Q9HAK2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EBF2Q9HAK2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EBF2Q9HAK2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EBF2Q9HAK2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EBF2Q9HAK2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EBF2Q9HAK2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EBF2Q9HAK2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EBF2Q9HAK2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EBF2Q9HAK2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EBF2Q9HAK2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EBF2Q9HAK2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EBF2Q9HAK2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EBF2Q9HAK2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EBF2Q9HAK2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EBF2Q9HAK2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EBF2Q9HAK2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EBF2Q9HAK2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EBF2Q9HAK2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EBF2Q9HAK2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EBF2Q9HAK2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EBF2Q9HAK2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EBF2Q9HAK2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EBF2Q9HAK2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EBF2Q9HAK2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EBF2Q9HAK2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EBF2Q9HAK2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EBF2Q9HAK2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EBF2Q9HAK2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EBF2Q9HAK2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EBF2Q9HAK2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EBF2Q9HAK2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
EBF2Q9HAK2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EBF2Q9HAK2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EBF2Q9HAK2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
EBF2Q9HAK2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
EBF2Q9HAK2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EBF2Q9HAK2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EBF2Q9HAK2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EBF2Q9HAK2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EBF2Q9HAK2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
EBF2Q9HAK2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EBF2Q9HAK2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EBF2Q9HAK2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EBF2Q9HAK2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EBF2Q9HAK2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EBF2Q9HAK2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EBF2Q9HAK2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EBF2Q9HAK2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EBF2Q9HAK2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EBF2Q9HAK2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EBF2Q9HAK2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms