Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VIPAS39Q9H9C1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VIPAS39Q9H9C1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VIPAS39Q9H9C1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VIPAS39Q9H9C1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
VIPAS39Q9H9C1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VIPAS39Q9H9C1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VIPAS39Q9H9C1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VIPAS39Q9H9C1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VIPAS39Q9H9C1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VIPAS39Q9H9C1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIPAS39Q9H9C1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VIPAS39Q9H9C1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VIPAS39Q9H9C1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VIPAS39Q9H9C1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VIPAS39Q9H9C1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VIPAS39Q9H9C1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VIPAS39Q9H9C1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VIPAS39Q9H9C1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VIPAS39Q9H9C1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VIPAS39Q9H9C1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VIPAS39Q9H9C1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VIPAS39Q9H9C1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VIPAS39Q9H9C1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VIPAS39Q9H9C1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VIPAS39Q9H9C1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VIPAS39Q9H9C1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VIPAS39Q9H9C1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VIPAS39Q9H9C1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VIPAS39Q9H9C1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VIPAS39Q9H9C1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VIPAS39Q9H9C1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VIPAS39Q9H9C1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIPAS39Q9H9C1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIPAS39Q9H9C1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VIPAS39Q9H9C1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VIPAS39Q9H9C1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VIPAS39Q9H9C1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VIPAS39Q9H9C1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VIPAS39Q9H9C1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VIPAS39Q9H9C1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VIPAS39Q9H9C1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIPAS39Q9H9C1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIPAS39Q9H9C1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIPAS39Q9H9C1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VIPAS39Q9H9C1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VIPAS39Q9H9C1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VIPAS39Q9H9C1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VIPAS39Q9H9C1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIPAS39Q9H9C1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIPAS39Q9H9C1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VIPAS39Q9H9C1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
VIPAS39Q9H9C1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VIPAS39Q9H9C1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VIPAS39Q9H9C1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VIPAS39Q9H9C1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIPAS39Q9H9C1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIPAS39Q9H9C1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIPAS39Q9H9C1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIPAS39Q9H9C1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIPAS39Q9H9C1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIPAS39Q9H9C1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIPAS39Q9H9C1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIPAS39Q9H9C1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIPAS39Q9H9C1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIPAS39Q9H9C1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIPAS39Q9H9C1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIPAS39Q9H9C1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIPAS39Q9H9C1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIPAS39Q9H9C1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIPAS39Q9H9C1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VIPAS39Q9H9C1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VIPAS39Q9H9C1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VIPAS39Q9H9C1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VIPAS39Q9H9C1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VIPAS39Q9H9C1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VIPAS39Q9H9C1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VIPAS39Q9H9C1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIPAS39Q9H9C1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIPAS39Q9H9C1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
VIPAS39Q9H9C1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VIPAS39Q9H9C1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VIPAS39Q9H9C1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VIPAS39Q9H9C1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIPAS39Q9H9C1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIPAS39Q9H9C1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIPAS39Q9H9C1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIPAS39Q9H9C1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIPAS39Q9H9C1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VIPAS39Q9H9C1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VIPAS39Q9H9C1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VIPAS39Q9H9C1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VIPAS39Q9H9C1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VIPAS39Q9H9C1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VIPAS39Q9H9C1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VIPAS39Q9H9C1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VIPAS39Q9H9C1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VIPAS39Q9H9C1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VIPAS39Q9H9C1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VIPAS39Q9H9C1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms