Protein–RNA interactions for Protein: Q9H503

BANF2, Barrier-to-autointegration factor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF2Q9H503 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BANF2Q9H503 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BANF2Q9H503 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BANF2Q9H503 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BANF2Q9H503 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BANF2Q9H503 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BANF2Q9H503 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BANF2Q9H503 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BANF2Q9H503 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BANF2Q9H503 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BANF2Q9H503 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BANF2Q9H503 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BANF2Q9H503 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BANF2Q9H503 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BANF2Q9H503 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BANF2Q9H503 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BANF2Q9H503 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BANF2Q9H503 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BANF2Q9H503 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BANF2Q9H503 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BANF2Q9H503 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BANF2Q9H503 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BANF2Q9H503 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BANF2Q9H503 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BANF2Q9H503 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BANF2Q9H503 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BANF2Q9H503 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BANF2Q9H503 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BANF2Q9H503 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BANF2Q9H503 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BANF2Q9H503 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BANF2Q9H503 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BANF2Q9H503 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BANF2Q9H503 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BANF2Q9H503 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BANF2Q9H503 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BANF2Q9H503 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BANF2Q9H503 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BANF2Q9H503 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BANF2Q9H503 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BANF2Q9H503 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BANF2Q9H503 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BANF2Q9H503 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BANF2Q9H503 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BANF2Q9H503 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BANF2Q9H503 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BANF2Q9H503 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BANF2Q9H503 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BANF2Q9H503 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BANF2Q9H503 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BANF2Q9H503 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BANF2Q9H503 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BANF2Q9H503 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BANF2Q9H503 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BANF2Q9H503 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BANF2Q9H503 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BANF2Q9H503 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BANF2Q9H503 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BANF2Q9H503 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BANF2Q9H503 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BANF2Q9H503 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BANF2Q9H503 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BANF2Q9H503 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BANF2Q9H503 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BANF2Q9H503 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BANF2Q9H503 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BANF2Q9H503 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BANF2Q9H503 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BANF2Q9H503 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BANF2Q9H503 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BANF2Q9H503 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BANF2Q9H503 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BANF2Q9H503 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BANF2Q9H503 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BANF2Q9H503 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BANF2Q9H503 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BANF2Q9H503 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BANF2Q9H503 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BANF2Q9H503 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BANF2Q9H503 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BANF2Q9H503 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BANF2Q9H503 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BANF2Q9H503 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BANF2Q9H503 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BANF2Q9H503 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BANF2Q9H503 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BANF2Q9H503 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BANF2Q9H503 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BANF2Q9H503 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BANF2Q9H503 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BANF2Q9H503 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BANF2Q9H503 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BANF2Q9H503 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BANF2Q9H503 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BANF2Q9H503 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BANF2Q9H503 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BANF2Q9H503 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BANF2Q9H503 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BANF2Q9H503 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BANF2Q9H503 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms