Protein–RNA interactions for Protein: Q9H270

VPS11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS11Q9H270 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS11Q9H270 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS11Q9H270 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS11Q9H270 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS11Q9H270 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS11Q9H270 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS11Q9H270 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS11Q9H270 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS11Q9H270 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS11Q9H270 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS11Q9H270 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS11Q9H270 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS11Q9H270 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS11Q9H270 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS11Q9H270 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS11Q9H270 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS11Q9H270 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS11Q9H270 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS11Q9H270 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS11Q9H270 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS11Q9H270 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS11Q9H270 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS11Q9H270 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS11Q9H270 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS11Q9H270 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS11Q9H270 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS11Q9H270 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS11Q9H270 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS11Q9H270 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS11Q9H270 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS11Q9H270 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS11Q9H270 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS11Q9H270 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS11Q9H270 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS11Q9H270 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VPS11Q9H270 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS11Q9H270 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS11Q9H270 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS11Q9H270 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS11Q9H270 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS11Q9H270 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS11Q9H270 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS11Q9H270 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS11Q9H270 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VPS11Q9H270 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS11Q9H270 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS11Q9H270 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS11Q9H270 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS11Q9H270 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS11Q9H270 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS11Q9H270 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS11Q9H270 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS11Q9H270 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS11Q9H270 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS11Q9H270 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS11Q9H270 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS11Q9H270 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS11Q9H270 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS11Q9H270 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS11Q9H270 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS11Q9H270 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS11Q9H270 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS11Q9H270 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS11Q9H270 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS11Q9H270 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS11Q9H270 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS11Q9H270 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS11Q9H270 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS11Q9H270 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS11Q9H270 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS11Q9H270 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS11Q9H270 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS11Q9H270 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS11Q9H270 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms