Protein–RNA interactions for Protein: Q9H239

MMP28, Matrix metalloproteinase-28, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP28Q9H239 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MMP28Q9H239 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP28Q9H239 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP28Q9H239 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP28Q9H239 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP28Q9H239 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MMP28Q9H239 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP28Q9H239 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MMP28Q9H239 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMP28Q9H239 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP28Q9H239 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP28Q9H239 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP28Q9H239 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP28Q9H239 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP28Q9H239 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMP28Q9H239 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP28Q9H239 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP28Q9H239 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMP28Q9H239 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP28Q9H239 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMP28Q9H239 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP28Q9H239 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP28Q9H239 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP28Q9H239 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP28Q9H239 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP28Q9H239 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP28Q9H239 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP28Q9H239 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP28Q9H239 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP28Q9H239 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP28Q9H239 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP28Q9H239 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP28Q9H239 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP28Q9H239 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP28Q9H239 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP28Q9H239 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP28Q9H239 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP28Q9H239 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP28Q9H239 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP28Q9H239 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP28Q9H239 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP28Q9H239 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP28Q9H239 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP28Q9H239 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP28Q9H239 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP28Q9H239 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP28Q9H239 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP28Q9H239 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP28Q9H239 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP28Q9H239 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP28Q9H239 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP28Q9H239 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP28Q9H239 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP28Q9H239 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP28Q9H239 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP28Q9H239 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP28Q9H239 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP28Q9H239 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP28Q9H239 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP28Q9H239 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP28Q9H239 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP28Q9H239 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP28Q9H239 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP28Q9H239 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP28Q9H239 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP28Q9H239 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP28Q9H239 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP28Q9H239 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP28Q9H239 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP28Q9H239 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP28Q9H239 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP28Q9H239 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP28Q9H239 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP28Q9H239 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP28Q9H239 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP28Q9H239 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP28Q9H239 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP28Q9H239 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP28Q9H239 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP28Q9H239 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP28Q9H239 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP28Q9H239 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP28Q9H239 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP28Q9H239 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP28Q9H239 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP28Q9H239 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP28Q9H239 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP28Q9H239 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP28Q9H239 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MMP28Q9H239 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP28Q9H239 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP28Q9H239 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP28Q9H239 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP28Q9H239 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP28Q9H239 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP28Q9H239 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP28Q9H239 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP28Q9H239 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP28Q9H239 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP28Q9H239 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.9 ms