Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NKX6-2Q9C056 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKX6-2Q9C056 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKX6-2Q9C056 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX6-2Q9C056 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX6-2Q9C056 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX6-2Q9C056 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX6-2Q9C056 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX6-2Q9C056 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKX6-2Q9C056 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKX6-2Q9C056 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKX6-2Q9C056 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKX6-2Q9C056 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKX6-2Q9C056 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKX6-2Q9C056 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKX6-2Q9C056 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKX6-2Q9C056 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX6-2Q9C056 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX6-2Q9C056 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX6-2Q9C056 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX6-2Q9C056 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX6-2Q9C056 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX6-2Q9C056 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX6-2Q9C056 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX6-2Q9C056 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX6-2Q9C056 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NKX6-2Q9C056 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKX6-2Q9C056 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NKX6-2Q9C056 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX6-2Q9C056 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX6-2Q9C056 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX6-2Q9C056 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX6-2Q9C056 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX6-2Q9C056 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NKX6-2Q9C056 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX6-2Q9C056 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX6-2Q9C056 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX6-2Q9C056 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX6-2Q9C056 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NKX6-2Q9C056 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NKX6-2Q9C056 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NKX6-2Q9C056 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX6-2Q9C056 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKX6-2Q9C056 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKX6-2Q9C056 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NKX6-2Q9C056 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NKX6-2Q9C056 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms