Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM5Q9C035 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM5Q9C035 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM5Q9C035 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM5Q9C035 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM5Q9C035 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM5Q9C035 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM5Q9C035 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM5Q9C035 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM5Q9C035 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM5Q9C035 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM5Q9C035 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM5Q9C035 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM5Q9C035 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM5Q9C035 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM5Q9C035 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM5Q9C035 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM5Q9C035 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM5Q9C035 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM5Q9C035 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM5Q9C035 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM5Q9C035 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM5Q9C035 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM5Q9C035 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM5Q9C035 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM5Q9C035 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM5Q9C035 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM5Q9C035 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM5Q9C035 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM5Q9C035 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM5Q9C035 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM5Q9C035 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM5Q9C035 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM5Q9C035 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM5Q9C035 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM5Q9C035 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM5Q9C035 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM5Q9C035 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM5Q9C035 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM5Q9C035 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM5Q9C035 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM5Q9C035 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM5Q9C035 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM5Q9C035 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM5Q9C035 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM5Q9C035 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM5Q9C035 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM5Q9C035 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM5Q9C035 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM5Q9C035 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM5Q9C035 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM5Q9C035 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM5Q9C035 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRIM5Q9C035 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM5Q9C035 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM5Q9C035 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM5Q9C035 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM5Q9C035 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM5Q9C035 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM5Q9C035 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM5Q9C035 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM5Q9C035 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM5Q9C035 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM5Q9C035 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM5Q9C035 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM5Q9C035 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM5Q9C035 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM5Q9C035 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM5Q9C035 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM5Q9C035 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM5Q9C035 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM5Q9C035 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM5Q9C035 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM5Q9C035 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM5Q9C035 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM5Q9C035 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM5Q9C035 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM5Q9C035 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM5Q9C035 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM5Q9C035 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM5Q9C035 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM5Q9C035 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM5Q9C035 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM5Q9C035 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM5Q9C035 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM5Q9C035 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM5Q9C035 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM5Q9C035 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRIM5Q9C035 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRIM5Q9C035 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM5Q9C035 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM5Q9C035 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM5Q9C035 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM5Q9C035 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM5Q9C035 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM5Q9C035 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM5Q9C035 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM5Q9C035 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM5Q9C035 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM5Q9C035 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms