Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCO2Q9BYV7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCO2Q9BYV7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BCO2Q9BYV7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCO2Q9BYV7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCO2Q9BYV7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCO2Q9BYV7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCO2Q9BYV7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCO2Q9BYV7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BCO2Q9BYV7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCO2Q9BYV7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCO2Q9BYV7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BCO2Q9BYV7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BCO2Q9BYV7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
BCO2Q9BYV7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCO2Q9BYV7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCO2Q9BYV7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCO2Q9BYV7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BCO2Q9BYV7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
BCO2Q9BYV7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCO2Q9BYV7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCO2Q9BYV7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCO2Q9BYV7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCO2Q9BYV7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCO2Q9BYV7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCO2Q9BYV7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCO2Q9BYV7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
BCO2Q9BYV7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCO2Q9BYV7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCO2Q9BYV7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCO2Q9BYV7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCO2Q9BYV7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCO2Q9BYV7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCO2Q9BYV7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCO2Q9BYV7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCO2Q9BYV7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCO2Q9BYV7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCO2Q9BYV7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCO2Q9BYV7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCO2Q9BYV7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCO2Q9BYV7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCO2Q9BYV7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BCO2Q9BYV7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCO2Q9BYV7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCO2Q9BYV7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BCO2Q9BYV7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BCO2Q9BYV7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCO2Q9BYV7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCO2Q9BYV7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCO2Q9BYV7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BCO2Q9BYV7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCO2Q9BYV7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCO2Q9BYV7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BCO2Q9BYV7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BCO2Q9BYV7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BCO2Q9BYV7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCO2Q9BYV7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCO2Q9BYV7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCO2Q9BYV7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCO2Q9BYV7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCO2Q9BYV7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCO2Q9BYV7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCO2Q9BYV7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCO2Q9BYV7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BCO2Q9BYV7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCO2Q9BYV7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCO2Q9BYV7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCO2Q9BYV7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
BCO2Q9BYV7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCO2Q9BYV7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCO2Q9BYV7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCO2Q9BYV7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCO2Q9BYV7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCO2Q9BYV7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCO2Q9BYV7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCO2Q9BYV7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCO2Q9BYV7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BCO2Q9BYV7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BCO2Q9BYV7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCO2Q9BYV7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCO2Q9BYV7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCO2Q9BYV7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCO2Q9BYV7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCO2Q9BYV7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCO2Q9BYV7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCO2Q9BYV7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCO2Q9BYV7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCO2Q9BYV7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCO2Q9BYV7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCO2Q9BYV7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BCO2Q9BYV7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BCO2Q9BYV7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCO2Q9BYV7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCO2Q9BYV7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCO2Q9BYV7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCO2Q9BYV7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCO2Q9BYV7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCO2Q9BYV7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCO2Q9BYV7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCO2Q9BYV7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms