Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
HIRIP3Q9BW71 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
HIRIP3Q9BW71 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
HIRIP3Q9BW71 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
HIRIP3Q9BW71 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
HIRIP3Q9BW71 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
HIRIP3Q9BW71 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.85■■■■□ 3.65
HIRIP3Q9BW71 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
HIRIP3Q9BW71 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
HIRIP3Q9BW71 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
HIRIP3Q9BW71 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
HIRIP3Q9BW71 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
HIRIP3Q9BW71 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
HIRIP3Q9BW71 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
HIRIP3Q9BW71 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
HIRIP3Q9BW71 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
HIRIP3Q9BW71 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
HIRIP3Q9BW71 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
HIRIP3Q9BW71 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
HIRIP3Q9BW71 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
HIRIP3Q9BW71 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
HIRIP3Q9BW71 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
HIRIP3Q9BW71 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
HIRIP3Q9BW71 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
HIRIP3Q9BW71 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
HIRIP3Q9BW71 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
HIRIP3Q9BW71 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
HIRIP3Q9BW71 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
HIRIP3Q9BW71 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
HIRIP3Q9BW71 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
HIRIP3Q9BW71 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
HIRIP3Q9BW71 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
HIRIP3Q9BW71 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
HIRIP3Q9BW71 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
HIRIP3Q9BW71 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
HIRIP3Q9BW71 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
HIRIP3Q9BW71 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
HIRIP3Q9BW71 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
HIRIP3Q9BW71 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
HIRIP3Q9BW71 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
HIRIP3Q9BW71 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
HIRIP3Q9BW71 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
HIRIP3Q9BW71 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.67■■■■□ 3.62
HIRIP3Q9BW71 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
HIRIP3Q9BW71 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
HIRIP3Q9BW71 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
HIRIP3Q9BW71 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
HIRIP3Q9BW71 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
HIRIP3Q9BW71 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
HIRIP3Q9BW71 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
HIRIP3Q9BW71 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
HIRIP3Q9BW71 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
HIRIP3Q9BW71 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
HIRIP3Q9BW71 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
HIRIP3Q9BW71 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
HIRIP3Q9BW71 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
HIRIP3Q9BW71 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
HIRIP3Q9BW71 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
HIRIP3Q9BW71 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
HIRIP3Q9BW71 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
HIRIP3Q9BW71 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
HIRIP3Q9BW71 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
HIRIP3Q9BW71 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
HIRIP3Q9BW71 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
HIRIP3Q9BW71 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
HIRIP3Q9BW71 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
HIRIP3Q9BW71 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
HIRIP3Q9BW71 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
HIRIP3Q9BW71 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
HIRIP3Q9BW71 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
HIRIP3Q9BW71 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
HIRIP3Q9BW71 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
HIRIP3Q9BW71 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
HIRIP3Q9BW71 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
HIRIP3Q9BW71 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
HIRIP3Q9BW71 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
HIRIP3Q9BW71 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
HIRIP3Q9BW71 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.6
HIRIP3Q9BW71 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
HIRIP3Q9BW71 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
HIRIP3Q9BW71 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
HIRIP3Q9BW71 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
HIRIP3Q9BW71 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
HIRIP3Q9BW71 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
HIRIP3Q9BW71 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
HIRIP3Q9BW71 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.48■■■■□ 3.59
HIRIP3Q9BW71 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
HIRIP3Q9BW71 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
HIRIP3Q9BW71 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
HIRIP3Q9BW71 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
HIRIP3Q9BW71 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
HIRIP3Q9BW71 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
HIRIP3Q9BW71 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
HIRIP3Q9BW71 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
HIRIP3Q9BW71 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
HIRIP3Q9BW71 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
HIRIP3Q9BW71 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
HIRIP3Q9BW71 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
HIRIP3Q9BW71 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
HIRIP3Q9BW71 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms