Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT3Q9BQG1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT3Q9BQG1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT3Q9BQG1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT3Q9BQG1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT3Q9BQG1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT3Q9BQG1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT3Q9BQG1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT3Q9BQG1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT3Q9BQG1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT3Q9BQG1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT3Q9BQG1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT3Q9BQG1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT3Q9BQG1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT3Q9BQG1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT3Q9BQG1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT3Q9BQG1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT3Q9BQG1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT3Q9BQG1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT3Q9BQG1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT3Q9BQG1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT3Q9BQG1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT3Q9BQG1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT3Q9BQG1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT3Q9BQG1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT3Q9BQG1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT3Q9BQG1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT3Q9BQG1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT3Q9BQG1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT3Q9BQG1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT3Q9BQG1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT3Q9BQG1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT3Q9BQG1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT3Q9BQG1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT3Q9BQG1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT3Q9BQG1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT3Q9BQG1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT3Q9BQG1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT3Q9BQG1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT3Q9BQG1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT3Q9BQG1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT3Q9BQG1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT3Q9BQG1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYT3Q9BQG1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT3Q9BQG1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT3Q9BQG1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT3Q9BQG1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT3Q9BQG1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT3Q9BQG1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT3Q9BQG1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT3Q9BQG1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT3Q9BQG1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT3Q9BQG1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT3Q9BQG1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT3Q9BQG1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT3Q9BQG1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT3Q9BQG1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT3Q9BQG1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT3Q9BQG1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT3Q9BQG1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT3Q9BQG1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT3Q9BQG1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms