Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST8

CEP89, Centrosomal protein of 89 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP89Q96ST8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP89Q96ST8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP89Q96ST8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CEP89Q96ST8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CEP89Q96ST8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP89Q96ST8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP89Q96ST8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP89Q96ST8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP89Q96ST8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP89Q96ST8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP89Q96ST8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP89Q96ST8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP89Q96ST8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP89Q96ST8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP89Q96ST8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP89Q96ST8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP89Q96ST8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP89Q96ST8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP89Q96ST8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP89Q96ST8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP89Q96ST8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP89Q96ST8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP89Q96ST8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP89Q96ST8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP89Q96ST8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP89Q96ST8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CEP89Q96ST8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CEP89Q96ST8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CEP89Q96ST8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CEP89Q96ST8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CEP89Q96ST8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CEP89Q96ST8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CEP89Q96ST8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CEP89Q96ST8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP89Q96ST8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP89Q96ST8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP89Q96ST8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP89Q96ST8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP89Q96ST8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP89Q96ST8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP89Q96ST8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP89Q96ST8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP89Q96ST8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CEP89Q96ST8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CEP89Q96ST8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CEP89Q96ST8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CEP89Q96ST8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP89Q96ST8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP89Q96ST8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP89Q96ST8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CEP89Q96ST8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CEP89Q96ST8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CEP89Q96ST8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CEP89Q96ST8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CEP89Q96ST8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CEP89Q96ST8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CEP89Q96ST8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CEP89Q96ST8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CEP89Q96ST8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CEP89Q96ST8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CEP89Q96ST8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP89Q96ST8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP89Q96ST8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP89Q96ST8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP89Q96ST8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP89Q96ST8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP89Q96ST8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP89Q96ST8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP89Q96ST8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP89Q96ST8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP89Q96ST8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CEP89Q96ST8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CEP89Q96ST8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CEP89Q96ST8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CEP89Q96ST8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CEP89Q96ST8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP89Q96ST8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CEP89Q96ST8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CEP89Q96ST8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CEP89Q96ST8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CEP89Q96ST8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CEP89Q96ST8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CEP89Q96ST8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CEP89Q96ST8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CEP89Q96ST8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CEP89Q96ST8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CEP89Q96ST8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CEP89Q96ST8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CEP89Q96ST8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CEP89Q96ST8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP89Q96ST8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CEP89Q96ST8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP89Q96ST8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP89Q96ST8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CEP89Q96ST8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP89Q96ST8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CEP89Q96ST8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CEP89Q96ST8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CEP89Q96ST8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CEP89Q96ST8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms