Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUDCD1Q96RS6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUDCD1Q96RS6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUDCD1Q96RS6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUDCD1Q96RS6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUDCD1Q96RS6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUDCD1Q96RS6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUDCD1Q96RS6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCD1Q96RS6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCD1Q96RS6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCD1Q96RS6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCD1Q96RS6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NUDCD1Q96RS6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCD1Q96RS6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCD1Q96RS6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCD1Q96RS6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUDCD1Q96RS6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUDCD1Q96RS6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUDCD1Q96RS6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUDCD1Q96RS6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUDCD1Q96RS6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUDCD1Q96RS6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUDCD1Q96RS6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUDCD1Q96RS6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUDCD1Q96RS6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUDCD1Q96RS6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUDCD1Q96RS6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUDCD1Q96RS6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCD1Q96RS6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUDCD1Q96RS6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUDCD1Q96RS6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUDCD1Q96RS6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUDCD1Q96RS6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUDCD1Q96RS6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUDCD1Q96RS6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUDCD1Q96RS6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUDCD1Q96RS6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NUDCD1Q96RS6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUDCD1Q96RS6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUDCD1Q96RS6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NUDCD1Q96RS6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUDCD1Q96RS6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NUDCD1Q96RS6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUDCD1Q96RS6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NUDCD1Q96RS6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUDCD1Q96RS6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUDCD1Q96RS6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUDCD1Q96RS6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUDCD1Q96RS6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUDCD1Q96RS6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUDCD1Q96RS6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUDCD1Q96RS6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NUDCD1Q96RS6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUDCD1Q96RS6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUDCD1Q96RS6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUDCD1Q96RS6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUDCD1Q96RS6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUDCD1Q96RS6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUDCD1Q96RS6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUDCD1Q96RS6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUDCD1Q96RS6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NUDCD1Q96RS6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUDCD1Q96RS6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUDCD1Q96RS6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUDCD1Q96RS6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUDCD1Q96RS6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUDCD1Q96RS6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUDCD1Q96RS6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUDCD1Q96RS6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUDCD1Q96RS6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUDCD1Q96RS6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUDCD1Q96RS6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUDCD1Q96RS6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUDCD1Q96RS6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NUDCD1Q96RS6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUDCD1Q96RS6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUDCD1Q96RS6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUDCD1Q96RS6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUDCD1Q96RS6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NUDCD1Q96RS6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUDCD1Q96RS6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUDCD1Q96RS6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUDCD1Q96RS6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUDCD1Q96RS6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUDCD1Q96RS6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUDCD1Q96RS6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUDCD1Q96RS6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUDCD1Q96RS6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUDCD1Q96RS6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUDCD1Q96RS6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NUDCD1Q96RS6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUDCD1Q96RS6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUDCD1Q96RS6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUDCD1Q96RS6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUDCD1Q96RS6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUDCD1Q96RS6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUDCD1Q96RS6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUDCD1Q96RS6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUDCD1Q96RS6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUDCD1Q96RS6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms