Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF560Q96MR9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF560Q96MR9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF560Q96MR9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF560Q96MR9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF560Q96MR9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF560Q96MR9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF560Q96MR9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF560Q96MR9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZNF560Q96MR9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZNF560Q96MR9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF560Q96MR9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF560Q96MR9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF560Q96MR9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF560Q96MR9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF560Q96MR9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF560Q96MR9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF560Q96MR9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF560Q96MR9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF560Q96MR9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF560Q96MR9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF560Q96MR9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF560Q96MR9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF560Q96MR9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF560Q96MR9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF560Q96MR9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF560Q96MR9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF560Q96MR9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF560Q96MR9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF560Q96MR9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF560Q96MR9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF560Q96MR9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF560Q96MR9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF560Q96MR9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF560Q96MR9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF560Q96MR9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF560Q96MR9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF560Q96MR9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF560Q96MR9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF560Q96MR9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF560Q96MR9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF560Q96MR9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF560Q96MR9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF560Q96MR9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZNF560Q96MR9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF560Q96MR9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF560Q96MR9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF560Q96MR9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF560Q96MR9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF560Q96MR9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF560Q96MR9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF560Q96MR9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF560Q96MR9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF560Q96MR9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF560Q96MR9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF560Q96MR9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF560Q96MR9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF560Q96MR9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF560Q96MR9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF560Q96MR9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF560Q96MR9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF560Q96MR9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF560Q96MR9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF560Q96MR9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF560Q96MR9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF560Q96MR9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF560Q96MR9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF560Q96MR9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF560Q96MR9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF560Q96MR9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF560Q96MR9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF560Q96MR9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF560Q96MR9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF560Q96MR9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF560Q96MR9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF560Q96MR9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms