Protein–RNA interactions for Protein: Q96L33

RHOV, Rho-related GTP-binding protein RhoV, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOVQ96L33 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOVQ96L33 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOVQ96L33 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOVQ96L33 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOVQ96L33 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOVQ96L33 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOVQ96L33 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RHOVQ96L33 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOVQ96L33 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOVQ96L33 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RHOVQ96L33 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOVQ96L33 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHOVQ96L33 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOVQ96L33 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHOVQ96L33 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOVQ96L33 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOVQ96L33 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOVQ96L33 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOVQ96L33 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RHOVQ96L33 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOVQ96L33 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOVQ96L33 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOVQ96L33 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOVQ96L33 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOVQ96L33 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOVQ96L33 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOVQ96L33 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHOVQ96L33 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RHOVQ96L33 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOVQ96L33 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOVQ96L33 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOVQ96L33 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOVQ96L33 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHOVQ96L33 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOVQ96L33 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOVQ96L33 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOVQ96L33 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOVQ96L33 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOVQ96L33 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHOVQ96L33 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOVQ96L33 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHOVQ96L33 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOVQ96L33 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOVQ96L33 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOVQ96L33 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOVQ96L33 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOVQ96L33 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOVQ96L33 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms