Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PHACTR3Q96KR7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PHACTR3Q96KR7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PHACTR3Q96KR7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
PHACTR3Q96KR7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
PHACTR3Q96KR7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
PHACTR3Q96KR7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PHACTR3Q96KR7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PHACTR3Q96KR7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PHACTR3Q96KR7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PHACTR3Q96KR7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PHACTR3Q96KR7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PHACTR3Q96KR7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PHACTR3Q96KR7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PHACTR3Q96KR7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PHACTR3Q96KR7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PHACTR3Q96KR7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PHACTR3Q96KR7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PHACTR3Q96KR7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PHACTR3Q96KR7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PHACTR3Q96KR7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
PHACTR3Q96KR7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PHACTR3Q96KR7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PHACTR3Q96KR7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PHACTR3Q96KR7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PHACTR3Q96KR7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PHACTR3Q96KR7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PHACTR3Q96KR7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PHACTR3Q96KR7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PHACTR3Q96KR7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PHACTR3Q96KR7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PHACTR3Q96KR7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PHACTR3Q96KR7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
PHACTR3Q96KR7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PHACTR3Q96KR7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PHACTR3Q96KR7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PHACTR3Q96KR7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
PHACTR3Q96KR7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PHACTR3Q96KR7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PHACTR3Q96KR7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PHACTR3Q96KR7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PHACTR3Q96KR7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PHACTR3Q96KR7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PHACTR3Q96KR7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PHACTR3Q96KR7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PHACTR3Q96KR7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PHACTR3Q96KR7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PHACTR3Q96KR7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PHACTR3Q96KR7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PHACTR3Q96KR7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PHACTR3Q96KR7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PHACTR3Q96KR7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PHACTR3Q96KR7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PHACTR3Q96KR7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PHACTR3Q96KR7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PHACTR3Q96KR7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PHACTR3Q96KR7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PHACTR3Q96KR7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PHACTR3Q96KR7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PHACTR3Q96KR7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PHACTR3Q96KR7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PHACTR3Q96KR7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PHACTR3Q96KR7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PHACTR3Q96KR7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PHACTR3Q96KR7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PHACTR3Q96KR7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PHACTR3Q96KR7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PHACTR3Q96KR7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PHACTR3Q96KR7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
PHACTR3Q96KR7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
PHACTR3Q96KR7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PHACTR3Q96KR7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PHACTR3Q96KR7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PHACTR3Q96KR7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PHACTR3Q96KR7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PHACTR3Q96KR7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PHACTR3Q96KR7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PHACTR3Q96KR7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PHACTR3Q96KR7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PHACTR3Q96KR7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PHACTR3Q96KR7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PHACTR3Q96KR7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PHACTR3Q96KR7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PHACTR3Q96KR7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PHACTR3Q96KR7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PHACTR3Q96KR7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PHACTR3Q96KR7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PHACTR3Q96KR7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PHACTR3Q96KR7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PHACTR3Q96KR7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PHACTR3Q96KR7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PHACTR3Q96KR7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PHACTR3Q96KR7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PHACTR3Q96KR7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PHACTR3Q96KR7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PHACTR3Q96KR7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PHACTR3Q96KR7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PHACTR3Q96KR7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
PHACTR3Q96KR7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PHACTR3Q96KR7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms