Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ABCC11Q96J66 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ABCC11Q96J66 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ABCC11Q96J66 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ABCC11Q96J66 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
ABCC11Q96J66 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
ABCC11Q96J66 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
ABCC11Q96J66 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
ABCC11Q96J66 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
ABCC11Q96J66 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
ABCC11Q96J66 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
ABCC11Q96J66 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
ABCC11Q96J66 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
ABCC11Q96J66 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
ABCC11Q96J66 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
ABCC11Q96J66 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
ABCC11Q96J66 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
ABCC11Q96J66 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
ABCC11Q96J66 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
ABCC11Q96J66 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
ABCC11Q96J66 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ABCC11Q96J66 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ABCC11Q96J66 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ABCC11Q96J66 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.58
ABCC11Q96J66 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
ABCC11Q96J66 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
ABCC11Q96J66 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ABCC11Q96J66 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ABCC11Q96J66 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
ABCC11Q96J66 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ABCC11Q96J66 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ABCC11Q96J66 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ABCC11Q96J66 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCC11Q96J66 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ABCC11Q96J66 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ABCC11Q96J66 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCC11Q96J66 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ABCC11Q96J66 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ABCC11Q96J66 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ABCC11Q96J66 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
ABCC11Q96J66 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ABCC11Q96J66 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ABCC11Q96J66 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ABCC11Q96J66 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ABCC11Q96J66 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ABCC11Q96J66 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ABCC11Q96J66 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ABCC11Q96J66 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ABCC11Q96J66 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ABCC11Q96J66 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ABCC11Q96J66 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCC11Q96J66 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ABCC11Q96J66 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ABCC11Q96J66 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ABCC11Q96J66 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ABCC11Q96J66 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ABCC11Q96J66 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ABCC11Q96J66 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ABCC11Q96J66 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ABCC11Q96J66 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ABCC11Q96J66 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ABCC11Q96J66 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ABCC11Q96J66 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ABCC11Q96J66 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
ABCC11Q96J66 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ABCC11Q96J66 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
ABCC11Q96J66 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ABCC11Q96J66 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ABCC11Q96J66 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ABCC11Q96J66 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ABCC11Q96J66 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ABCC11Q96J66 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
ABCC11Q96J66 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
ABCC11Q96J66 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ABCC11Q96J66 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ABCC11Q96J66 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
ABCC11Q96J66 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
ABCC11Q96J66 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
ABCC11Q96J66 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
ABCC11Q96J66 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
ABCC11Q96J66 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
ABCC11Q96J66 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
ABCC11Q96J66 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ABCC11Q96J66 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ABCC11Q96J66 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ABCC11Q96J66 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ABCC11Q96J66 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ABCC11Q96J66 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ABCC11Q96J66 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ABCC11Q96J66 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ABCC11Q96J66 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ABCC11Q96J66 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
ABCC11Q96J66 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
ABCC11Q96J66 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC11Q96J66 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC11Q96J66 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC11Q96J66 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC11Q96J66 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC11Q96J66 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC11Q96J66 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms