Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
BCANQ96GW7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
BCANQ96GW7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
BCANQ96GW7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
BCANQ96GW7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
BCANQ96GW7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC38.34■■■■□ 3.73
BCANQ96GW7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
BCANQ96GW7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
BCANQ96GW7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
BCANQ96GW7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
BCANQ96GW7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
BCANQ96GW7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
BCANQ96GW7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
BCANQ96GW7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
BCANQ96GW7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
BCANQ96GW7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
BCANQ96GW7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
BCANQ96GW7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
BCANQ96GW7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
BCANQ96GW7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
BCANQ96GW7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
BCANQ96GW7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
BCANQ96GW7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
BCANQ96GW7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
BCANQ96GW7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
BCANQ96GW7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
BCANQ96GW7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
BCANQ96GW7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
BCANQ96GW7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
BCANQ96GW7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
BCANQ96GW7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
BCANQ96GW7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
BCANQ96GW7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
BCANQ96GW7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
BCANQ96GW7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
BCANQ96GW7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
BCANQ96GW7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
BCANQ96GW7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
BCANQ96GW7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
BCANQ96GW7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
BCANQ96GW7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
BCANQ96GW7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
BCANQ96GW7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.13■■■■□ 3.69
BCANQ96GW7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
BCANQ96GW7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
BCANQ96GW7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
BCANQ96GW7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
BCANQ96GW7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
BCANQ96GW7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
BCANQ96GW7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
BCANQ96GW7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
BCANQ96GW7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
BCANQ96GW7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
BCANQ96GW7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
BCANQ96GW7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
BCANQ96GW7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
BCANQ96GW7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
BCANQ96GW7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
BCANQ96GW7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
BCANQ96GW7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
BCANQ96GW7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
BCANQ96GW7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
BCANQ96GW7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
BCANQ96GW7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
BCANQ96GW7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
BCANQ96GW7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
BCANQ96GW7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
BCANQ96GW7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
BCANQ96GW7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
BCANQ96GW7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
BCANQ96GW7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
BCANQ96GW7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
BCANQ96GW7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
BCANQ96GW7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
BCANQ96GW7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
BCANQ96GW7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
BCANQ96GW7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
BCANQ96GW7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
BCANQ96GW7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
BCANQ96GW7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
BCANQ96GW7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
BCANQ96GW7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
BCANQ96GW7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
BCANQ96GW7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
BCANQ96GW7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
BCANQ96GW7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
BCANQ96GW7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
BCANQ96GW7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
BCANQ96GW7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
BCANQ96GW7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
BCANQ96GW7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
BCANQ96GW7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
BCANQ96GW7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
BCANQ96GW7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
BCANQ96GW7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
BCANQ96GW7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
BCANQ96GW7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
BCANQ96GW7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
BCANQ96GW7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
BCANQ96GW7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms