Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RMDN1Q96DB5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RMDN1Q96DB5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RMDN1Q96DB5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RMDN1Q96DB5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RMDN1Q96DB5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RMDN1Q96DB5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RMDN1Q96DB5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RMDN1Q96DB5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RMDN1Q96DB5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RMDN1Q96DB5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RMDN1Q96DB5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RMDN1Q96DB5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RMDN1Q96DB5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RMDN1Q96DB5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RMDN1Q96DB5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RMDN1Q96DB5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RMDN1Q96DB5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RMDN1Q96DB5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RMDN1Q96DB5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RMDN1Q96DB5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RMDN1Q96DB5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RMDN1Q96DB5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RMDN1Q96DB5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RMDN1Q96DB5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RMDN1Q96DB5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RMDN1Q96DB5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RMDN1Q96DB5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RMDN1Q96DB5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RMDN1Q96DB5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RMDN1Q96DB5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RMDN1Q96DB5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RMDN1Q96DB5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RMDN1Q96DB5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RMDN1Q96DB5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RMDN1Q96DB5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RMDN1Q96DB5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RMDN1Q96DB5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RMDN1Q96DB5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RMDN1Q96DB5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RMDN1Q96DB5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RMDN1Q96DB5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RMDN1Q96DB5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RMDN1Q96DB5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RMDN1Q96DB5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms