Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY4

TTC28, Tetratricopeptide repeat protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 2,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28Q96AY4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC28Q96AY4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC28Q96AY4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TTC28Q96AY4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTC28Q96AY4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC28Q96AY4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC28Q96AY4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC28Q96AY4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC28Q96AY4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC28Q96AY4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC28Q96AY4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TTC28Q96AY4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC28Q96AY4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC28Q96AY4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC28Q96AY4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC28Q96AY4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC28Q96AY4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC28Q96AY4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC28Q96AY4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC28Q96AY4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC28Q96AY4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC28Q96AY4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC28Q96AY4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC28Q96AY4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC28Q96AY4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC28Q96AY4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TTC28Q96AY4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TTC28Q96AY4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TTC28Q96AY4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC28Q96AY4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC28Q96AY4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC28Q96AY4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC28Q96AY4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC28Q96AY4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC28Q96AY4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC28Q96AY4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC28Q96AY4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC28Q96AY4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC28Q96AY4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC28Q96AY4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC28Q96AY4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC28Q96AY4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC28Q96AY4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC28Q96AY4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC28Q96AY4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC28Q96AY4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC28Q96AY4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC28Q96AY4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC28Q96AY4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC28Q96AY4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC28Q96AY4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC28Q96AY4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC28Q96AY4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC28Q96AY4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC28Q96AY4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC28Q96AY4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC28Q96AY4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC28Q96AY4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC28Q96AY4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC28Q96AY4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC28Q96AY4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC28Q96AY4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC28Q96AY4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC28Q96AY4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC28Q96AY4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC28Q96AY4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC28Q96AY4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC28Q96AY4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC28Q96AY4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC28Q96AY4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC28Q96AY4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC28Q96AY4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC28Q96AY4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC28Q96AY4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC28Q96AY4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC28Q96AY4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTC28Q96AY4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTC28Q96AY4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTC28Q96AY4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TTC28Q96AY4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTC28Q96AY4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
TTC28Q96AY4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC28Q96AY4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTC28Q96AY4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC28Q96AY4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC28Q96AY4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC28Q96AY4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC28Q96AY4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC28Q96AY4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC28Q96AY4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC28Q96AY4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC28Q96AY4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC28Q96AY4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC28Q96AY4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC28Q96AY4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TTC28Q96AY4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTC28Q96AY4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TTC28Q96AY4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTC28Q96AY4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TTC28Q96AY4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms