Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED12Q93074 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MED12Q93074 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED12Q93074 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED12Q93074 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED12Q93074 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED12Q93074 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED12Q93074 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED12Q93074 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED12Q93074 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED12Q93074 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED12Q93074 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED12Q93074 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED12Q93074 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED12Q93074 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED12Q93074 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED12Q93074 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED12Q93074 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MED12Q93074 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MED12Q93074 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MED12Q93074 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED12Q93074 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED12Q93074 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MED12Q93074 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED12Q93074 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED12Q93074 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MED12Q93074 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED12Q93074 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED12Q93074 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED12Q93074 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED12Q93074 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED12Q93074 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED12Q93074 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED12Q93074 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED12Q93074 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED12Q93074 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED12Q93074 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED12Q93074 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED12Q93074 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED12Q93074 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED12Q93074 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED12Q93074 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED12Q93074 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED12Q93074 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
MED12Q93074 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED12Q93074 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MED12Q93074 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED12Q93074 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED12Q93074 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED12Q93074 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED12Q93074 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MED12Q93074 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED12Q93074 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MED12Q93074 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED12Q93074 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED12Q93074 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED12Q93074 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED12Q93074 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED12Q93074 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED12Q93074 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MED12Q93074 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MED12Q93074 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MED12Q93074 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED12Q93074 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED12Q93074 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED12Q93074 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED12Q93074 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED12Q93074 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED12Q93074 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED12Q93074 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED12Q93074 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED12Q93074 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED12Q93074 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED12Q93074 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED12Q93074 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED12Q93074 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED12Q93074 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED12Q93074 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED12Q93074 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED12Q93074 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MED12Q93074 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED12Q93074 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED12Q93074 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MED12Q93074 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MED12Q93074 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED12Q93074 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MED12Q93074 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED12Q93074 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED12Q93074 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MED12Q93074 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED12Q93074 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED12Q93074 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED12Q93074 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED12Q93074 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED12Q93074 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MED12Q93074 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MED12Q93074 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED12Q93074 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED12Q93074 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED12Q93074 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms