Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GATA6Q92908 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GATA6Q92908 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GATA6Q92908 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GATA6Q92908 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GATA6Q92908 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GATA6Q92908 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GATA6Q92908 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GATA6Q92908 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GATA6Q92908 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GATA6Q92908 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GATA6Q92908 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GATA6Q92908 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GATA6Q92908 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GATA6Q92908 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GATA6Q92908 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GATA6Q92908 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GATA6Q92908 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GATA6Q92908 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GATA6Q92908 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GATA6Q92908 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GATA6Q92908 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GATA6Q92908 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GATA6Q92908 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GATA6Q92908 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GATA6Q92908 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GATA6Q92908 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GATA6Q92908 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GATA6Q92908 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GATA6Q92908 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GATA6Q92908 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GATA6Q92908 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GATA6Q92908 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GATA6Q92908 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GATA6Q92908 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GATA6Q92908 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GATA6Q92908 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GATA6Q92908 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GATA6Q92908 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GATA6Q92908 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GATA6Q92908 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GATA6Q92908 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GATA6Q92908 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GATA6Q92908 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GATA6Q92908 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GATA6Q92908 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GATA6Q92908 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GATA6Q92908 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GATA6Q92908 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GATA6Q92908 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GATA6Q92908 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GATA6Q92908 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GATA6Q92908 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GATA6Q92908 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GATA6Q92908 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GATA6Q92908 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GATA6Q92908 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GATA6Q92908 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GATA6Q92908 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GATA6Q92908 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GATA6Q92908 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GATA6Q92908 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GATA6Q92908 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GATA6Q92908 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GATA6Q92908 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GATA6Q92908 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GATA6Q92908 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GATA6Q92908 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GATA6Q92908 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GATA6Q92908 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GATA6Q92908 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GATA6Q92908 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GATA6Q92908 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GATA6Q92908 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GATA6Q92908 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GATA6Q92908 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GATA6Q92908 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GATA6Q92908 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GATA6Q92908 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GATA6Q92908 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GATA6Q92908 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GATA6Q92908 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GATA6Q92908 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GATA6Q92908 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GATA6Q92908 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GATA6Q92908 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GATA6Q92908 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms