Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC4Q92889 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERCC4Q92889 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
ERCC4Q92889 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERCC4Q92889 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERCC4Q92889 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERCC4Q92889 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERCC4Q92889 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC4Q92889 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC4Q92889 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC4Q92889 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC4Q92889 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC4Q92889 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC4Q92889 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC4Q92889 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC4Q92889 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERCC4Q92889 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC4Q92889 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC4Q92889 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC4Q92889 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC4Q92889 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC4Q92889 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC4Q92889 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC4Q92889 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC4Q92889 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC4Q92889 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC4Q92889 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC4Q92889 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC4Q92889 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC4Q92889 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC4Q92889 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC4Q92889 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC4Q92889 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC4Q92889 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC4Q92889 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC4Q92889 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC4Q92889 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC4Q92889 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC4Q92889 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERCC4Q92889 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERCC4Q92889 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERCC4Q92889 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERCC4Q92889 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ERCC4Q92889 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERCC4Q92889 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERCC4Q92889 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERCC4Q92889 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERCC4Q92889 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ERCC4Q92889 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERCC4Q92889 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC4Q92889 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC4Q92889 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ERCC4Q92889 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERCC4Q92889 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERCC4Q92889 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERCC4Q92889 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERCC4Q92889 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ERCC4Q92889 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ERCC4Q92889 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERCC4Q92889 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC4Q92889 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC4Q92889 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC4Q92889 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC4Q92889 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC4Q92889 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC4Q92889 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC4Q92889 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC4Q92889 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC4Q92889 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERCC4Q92889 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERCC4Q92889 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERCC4Q92889 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERCC4Q92889 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC4Q92889 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC4Q92889 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC4Q92889 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC4Q92889 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERCC4Q92889 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERCC4Q92889 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC4Q92889 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC4Q92889 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC4Q92889 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERCC4Q92889 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERCC4Q92889 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC4Q92889 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC4Q92889 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC4Q92889 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC4Q92889 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC4Q92889 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC4Q92889 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC4Q92889 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERCC4Q92889 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERCC4Q92889 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERCC4Q92889 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERCC4Q92889 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ERCC4Q92889 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC4Q92889 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC4Q92889 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC4Q92889 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC4Q92889 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms