Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF3Q92576 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF3Q92576 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF3Q92576 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF3Q92576 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF3Q92576 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHF3Q92576 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF3Q92576 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF3Q92576 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF3Q92576 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF3Q92576 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF3Q92576 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF3Q92576 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF3Q92576 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF3Q92576 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHF3Q92576 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF3Q92576 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF3Q92576 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF3Q92576 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF3Q92576 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF3Q92576 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF3Q92576 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF3Q92576 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF3Q92576 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF3Q92576 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF3Q92576 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF3Q92576 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF3Q92576 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF3Q92576 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF3Q92576 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF3Q92576 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF3Q92576 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF3Q92576 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF3Q92576 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF3Q92576 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF3Q92576 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF3Q92576 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF3Q92576 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF3Q92576 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF3Q92576 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PHF3Q92576 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHF3Q92576 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF3Q92576 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF3Q92576 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF3Q92576 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF3Q92576 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF3Q92576 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF3Q92576 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF3Q92576 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF3Q92576 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms