Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D1Q8WV19 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFT2D1Q8WV19 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFT2D1Q8WV19 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFT2D1Q8WV19 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFT2D1Q8WV19 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFT2D1Q8WV19 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D1Q8WV19 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D1Q8WV19 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D1Q8WV19 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D1Q8WV19 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D1Q8WV19 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFT2D1Q8WV19 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFT2D1Q8WV19 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFT2D1Q8WV19 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFT2D1Q8WV19 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFT2D1Q8WV19 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFT2D1Q8WV19 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFT2D1Q8WV19 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFT2D1Q8WV19 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFT2D1Q8WV19 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFT2D1Q8WV19 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SFT2D1Q8WV19 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SFT2D1Q8WV19 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFT2D1Q8WV19 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFT2D1Q8WV19 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFT2D1Q8WV19 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFT2D1Q8WV19 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFT2D1Q8WV19 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFT2D1Q8WV19 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFT2D1Q8WV19 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFT2D1Q8WV19 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFT2D1Q8WV19 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFT2D1Q8WV19 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFT2D1Q8WV19 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFT2D1Q8WV19 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFT2D1Q8WV19 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFT2D1Q8WV19 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFT2D1Q8WV19 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFT2D1Q8WV19 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFT2D1Q8WV19 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFT2D1Q8WV19 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFT2D1Q8WV19 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFT2D1Q8WV19 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFT2D1Q8WV19 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFT2D1Q8WV19 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D1Q8WV19 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D1Q8WV19 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D1Q8WV19 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D1Q8WV19 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D1Q8WV19 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D1Q8WV19 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFT2D1Q8WV19 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFT2D1Q8WV19 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFT2D1Q8WV19 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFT2D1Q8WV19 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SFT2D1Q8WV19 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFT2D1Q8WV19 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SFT2D1Q8WV19 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SFT2D1Q8WV19 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SFT2D1Q8WV19 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SFT2D1Q8WV19 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SFT2D1Q8WV19 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SFT2D1Q8WV19 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFT2D1Q8WV19 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SFT2D1Q8WV19 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFT2D1Q8WV19 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SFT2D1Q8WV19 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFT2D1Q8WV19 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFT2D1Q8WV19 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFT2D1Q8WV19 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SFT2D1Q8WV19 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFT2D1Q8WV19 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFT2D1Q8WV19 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms