Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBX8

PIP4K2C, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2CQ8TBX8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2CQ8TBX8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2CQ8TBX8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2CQ8TBX8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2CQ8TBX8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIP4K2CQ8TBX8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIP4K2CQ8TBX8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIP4K2CQ8TBX8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2CQ8TBX8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2CQ8TBX8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2CQ8TBX8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2CQ8TBX8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2CQ8TBX8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2CQ8TBX8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2CQ8TBX8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2CQ8TBX8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2CQ8TBX8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2CQ8TBX8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2CQ8TBX8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2CQ8TBX8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PIP4K2CQ8TBX8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIP4K2CQ8TBX8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIP4K2CQ8TBX8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIP4K2CQ8TBX8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIP4K2CQ8TBX8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PIP4K2CQ8TBX8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PIP4K2CQ8TBX8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIP4K2CQ8TBX8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIP4K2CQ8TBX8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIP4K2CQ8TBX8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIP4K2CQ8TBX8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIP4K2CQ8TBX8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIP4K2CQ8TBX8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PIP4K2CQ8TBX8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIP4K2CQ8TBX8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIP4K2CQ8TBX8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIP4K2CQ8TBX8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PIP4K2CQ8TBX8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIP4K2CQ8TBX8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIP4K2CQ8TBX8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PIP4K2CQ8TBX8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIP4K2CQ8TBX8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIP4K2CQ8TBX8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIP4K2CQ8TBX8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIP4K2CQ8TBX8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIP4K2CQ8TBX8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIP4K2CQ8TBX8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIP4K2CQ8TBX8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIP4K2CQ8TBX8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIP4K2CQ8TBX8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIP4K2CQ8TBX8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PIP4K2CQ8TBX8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIP4K2CQ8TBX8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIP4K2CQ8TBX8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIP4K2CQ8TBX8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIP4K2CQ8TBX8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIP4K2CQ8TBX8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PIP4K2CQ8TBX8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PIP4K2CQ8TBX8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PIP4K2CQ8TBX8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PIP4K2CQ8TBX8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PIP4K2CQ8TBX8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PIP4K2CQ8TBX8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PIP4K2CQ8TBX8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PIP4K2CQ8TBX8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PIP4K2CQ8TBX8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PIP4K2CQ8TBX8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIP4K2CQ8TBX8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIP4K2CQ8TBX8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIP4K2CQ8TBX8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIP4K2CQ8TBX8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIP4K2CQ8TBX8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIP4K2CQ8TBX8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIP4K2CQ8TBX8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PIP4K2CQ8TBX8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIP4K2CQ8TBX8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIP4K2CQ8TBX8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIP4K2CQ8TBX8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIP4K2CQ8TBX8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIP4K2CQ8TBX8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PIP4K2CQ8TBX8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PIP4K2CQ8TBX8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PIP4K2CQ8TBX8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PIP4K2CQ8TBX8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIP4K2CQ8TBX8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIP4K2CQ8TBX8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIP4K2CQ8TBX8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIP4K2CQ8TBX8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIP4K2CQ8TBX8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIP4K2CQ8TBX8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIP4K2CQ8TBX8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIP4K2CQ8TBX8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIP4K2CQ8TBX8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIP4K2CQ8TBX8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PIP4K2CQ8TBX8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIP4K2CQ8TBX8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIP4K2CQ8TBX8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIP4K2CQ8TBX8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIP4K2CQ8TBX8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIP4K2CQ8TBX8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms