Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF397Q8NF99 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF397Q8NF99 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF397Q8NF99 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF397Q8NF99 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF397Q8NF99 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF397Q8NF99 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF397Q8NF99 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF397Q8NF99 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF397Q8NF99 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF397Q8NF99 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF397Q8NF99 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF397Q8NF99 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF397Q8NF99 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF397Q8NF99 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF397Q8NF99 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF397Q8NF99 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF397Q8NF99 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF397Q8NF99 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF397Q8NF99 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF397Q8NF99 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF397Q8NF99 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF397Q8NF99 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF397Q8NF99 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF397Q8NF99 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF397Q8NF99 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF397Q8NF99 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF397Q8NF99 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF397Q8NF99 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF397Q8NF99 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF397Q8NF99 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF397Q8NF99 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF397Q8NF99 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF397Q8NF99 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF397Q8NF99 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF397Q8NF99 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF397Q8NF99 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF397Q8NF99 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF397Q8NF99 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF397Q8NF99 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF397Q8NF99 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF397Q8NF99 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF397Q8NF99 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF397Q8NF99 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF397Q8NF99 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF397Q8NF99 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF397Q8NF99 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF397Q8NF99 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF397Q8NF99 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF397Q8NF99 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF397Q8NF99 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF397Q8NF99 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF397Q8NF99 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF397Q8NF99 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF397Q8NF99 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF397Q8NF99 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF397Q8NF99 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF397Q8NF99 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF397Q8NF99 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF397Q8NF99 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF397Q8NF99 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF397Q8NF99 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF397Q8NF99 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF397Q8NF99 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF397Q8NF99 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF397Q8NF99 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF397Q8NF99 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF397Q8NF99 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF397Q8NF99 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF397Q8NF99 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF397Q8NF99 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF397Q8NF99 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF397Q8NF99 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF397Q8NF99 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF397Q8NF99 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF397Q8NF99 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF397Q8NF99 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF397Q8NF99 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF397Q8NF99 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF397Q8NF99 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF397Q8NF99 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF397Q8NF99 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF397Q8NF99 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF397Q8NF99 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF397Q8NF99 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF397Q8NF99 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF397Q8NF99 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF397Q8NF99 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF397Q8NF99 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF397Q8NF99 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF397Q8NF99 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF397Q8NF99 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF397Q8NF99 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF397Q8NF99 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF397Q8NF99 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF397Q8NF99 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF397Q8NF99 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF397Q8NF99 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF397Q8NF99 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF397Q8NF99 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms