Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG2

C7orf57, Uncharacterized protein C7orf57, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf57Q8NEG2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C7orf57Q8NEG2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C7orf57Q8NEG2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C7orf57Q8NEG2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C7orf57Q8NEG2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C7orf57Q8NEG2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C7orf57Q8NEG2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C7orf57Q8NEG2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C7orf57Q8NEG2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C7orf57Q8NEG2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C7orf57Q8NEG2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C7orf57Q8NEG2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C7orf57Q8NEG2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C7orf57Q8NEG2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C7orf57Q8NEG2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C7orf57Q8NEG2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C7orf57Q8NEG2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C7orf57Q8NEG2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C7orf57Q8NEG2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C7orf57Q8NEG2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C7orf57Q8NEG2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C7orf57Q8NEG2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C7orf57Q8NEG2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C7orf57Q8NEG2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C7orf57Q8NEG2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C7orf57Q8NEG2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C7orf57Q8NEG2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C7orf57Q8NEG2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C7orf57Q8NEG2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf57Q8NEG2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf57Q8NEG2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf57Q8NEG2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf57Q8NEG2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf57Q8NEG2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf57Q8NEG2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C7orf57Q8NEG2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C7orf57Q8NEG2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C7orf57Q8NEG2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C7orf57Q8NEG2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C7orf57Q8NEG2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C7orf57Q8NEG2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C7orf57Q8NEG2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C7orf57Q8NEG2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C7orf57Q8NEG2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C7orf57Q8NEG2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C7orf57Q8NEG2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C7orf57Q8NEG2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C7orf57Q8NEG2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C7orf57Q8NEG2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C7orf57Q8NEG2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C7orf57Q8NEG2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C7orf57Q8NEG2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C7orf57Q8NEG2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C7orf57Q8NEG2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C7orf57Q8NEG2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C7orf57Q8NEG2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C7orf57Q8NEG2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C7orf57Q8NEG2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C7orf57Q8NEG2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C7orf57Q8NEG2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C7orf57Q8NEG2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C7orf57Q8NEG2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C7orf57Q8NEG2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C7orf57Q8NEG2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C7orf57Q8NEG2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C7orf57Q8NEG2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C7orf57Q8NEG2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C7orf57Q8NEG2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C7orf57Q8NEG2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C7orf57Q8NEG2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C7orf57Q8NEG2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C7orf57Q8NEG2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C7orf57Q8NEG2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C7orf57Q8NEG2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C7orf57Q8NEG2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf57Q8NEG2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf57Q8NEG2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf57Q8NEG2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C7orf57Q8NEG2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C7orf57Q8NEG2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C7orf57Q8NEG2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C7orf57Q8NEG2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C7orf57Q8NEG2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C7orf57Q8NEG2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C7orf57Q8NEG2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C7orf57Q8NEG2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C7orf57Q8NEG2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C7orf57Q8NEG2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C7orf57Q8NEG2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C7orf57Q8NEG2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C7orf57Q8NEG2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C7orf57Q8NEG2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C7orf57Q8NEG2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C7orf57Q8NEG2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C7orf57Q8NEG2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C7orf57Q8NEG2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C7orf57Q8NEG2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C7orf57Q8NEG2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C7orf57Q8NEG2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C7orf57Q8NEG2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms