Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF9

SRFBP1, Serum response factor-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFBP1Q8NEF9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRFBP1Q8NEF9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRFBP1Q8NEF9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRFBP1Q8NEF9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRFBP1Q8NEF9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRFBP1Q8NEF9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRFBP1Q8NEF9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRFBP1Q8NEF9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRFBP1Q8NEF9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRFBP1Q8NEF9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRFBP1Q8NEF9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRFBP1Q8NEF9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRFBP1Q8NEF9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRFBP1Q8NEF9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRFBP1Q8NEF9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRFBP1Q8NEF9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRFBP1Q8NEF9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SRFBP1Q8NEF9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRFBP1Q8NEF9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRFBP1Q8NEF9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRFBP1Q8NEF9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRFBP1Q8NEF9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRFBP1Q8NEF9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRFBP1Q8NEF9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRFBP1Q8NEF9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRFBP1Q8NEF9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRFBP1Q8NEF9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRFBP1Q8NEF9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRFBP1Q8NEF9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRFBP1Q8NEF9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRFBP1Q8NEF9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRFBP1Q8NEF9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRFBP1Q8NEF9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRFBP1Q8NEF9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRFBP1Q8NEF9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRFBP1Q8NEF9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRFBP1Q8NEF9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRFBP1Q8NEF9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRFBP1Q8NEF9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRFBP1Q8NEF9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRFBP1Q8NEF9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRFBP1Q8NEF9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRFBP1Q8NEF9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRFBP1Q8NEF9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SRFBP1Q8NEF9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SRFBP1Q8NEF9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRFBP1Q8NEF9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRFBP1Q8NEF9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRFBP1Q8NEF9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRFBP1Q8NEF9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRFBP1Q8NEF9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRFBP1Q8NEF9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRFBP1Q8NEF9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRFBP1Q8NEF9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRFBP1Q8NEF9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRFBP1Q8NEF9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRFBP1Q8NEF9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRFBP1Q8NEF9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SRFBP1Q8NEF9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRFBP1Q8NEF9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRFBP1Q8NEF9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRFBP1Q8NEF9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRFBP1Q8NEF9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRFBP1Q8NEF9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRFBP1Q8NEF9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SRFBP1Q8NEF9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRFBP1Q8NEF9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRFBP1Q8NEF9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRFBP1Q8NEF9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRFBP1Q8NEF9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRFBP1Q8NEF9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRFBP1Q8NEF9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRFBP1Q8NEF9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRFBP1Q8NEF9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRFBP1Q8NEF9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRFBP1Q8NEF9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRFBP1Q8NEF9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRFBP1Q8NEF9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRFBP1Q8NEF9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRFBP1Q8NEF9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRFBP1Q8NEF9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRFBP1Q8NEF9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRFBP1Q8NEF9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRFBP1Q8NEF9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRFBP1Q8NEF9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SRFBP1Q8NEF9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRFBP1Q8NEF9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRFBP1Q8NEF9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRFBP1Q8NEF9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRFBP1Q8NEF9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRFBP1Q8NEF9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRFBP1Q8NEF9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRFBP1Q8NEF9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRFBP1Q8NEF9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRFBP1Q8NEF9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRFBP1Q8NEF9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRFBP1Q8NEF9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRFBP1Q8NEF9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRFBP1Q8NEF9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SRFBP1Q8NEF9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms