Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TMEM87AQ8NBN3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TMEM87AQ8NBN3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TMEM87AQ8NBN3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMEM87AQ8NBN3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMEM87AQ8NBN3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMEM87AQ8NBN3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMEM87AQ8NBN3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMEM87AQ8NBN3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMEM87AQ8NBN3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMEM87AQ8NBN3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TMEM87AQ8NBN3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TMEM87AQ8NBN3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
TMEM87AQ8NBN3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TMEM87AQ8NBN3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMEM87AQ8NBN3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMEM87AQ8NBN3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMEM87AQ8NBN3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMEM87AQ8NBN3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMEM87AQ8NBN3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMEM87AQ8NBN3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMEM87AQ8NBN3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMEM87AQ8NBN3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TMEM87AQ8NBN3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TMEM87AQ8NBN3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TMEM87AQ8NBN3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TMEM87AQ8NBN3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TMEM87AQ8NBN3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TMEM87AQ8NBN3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TMEM87AQ8NBN3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TMEM87AQ8NBN3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMEM87AQ8NBN3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMEM87AQ8NBN3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMEM87AQ8NBN3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
TMEM87AQ8NBN3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMEM87AQ8NBN3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMEM87AQ8NBN3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMEM87AQ8NBN3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMEM87AQ8NBN3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMEM87AQ8NBN3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TMEM87AQ8NBN3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TMEM87AQ8NBN3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TMEM87AQ8NBN3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
TMEM87AQ8NBN3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMEM87AQ8NBN3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMEM87AQ8NBN3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMEM87AQ8NBN3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMEM87AQ8NBN3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMEM87AQ8NBN3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMEM87AQ8NBN3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMEM87AQ8NBN3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMEM87AQ8NBN3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMEM87AQ8NBN3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMEM87AQ8NBN3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TMEM87AQ8NBN3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMEM87AQ8NBN3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMEM87AQ8NBN3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMEM87AQ8NBN3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMEM87AQ8NBN3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TMEM87AQ8NBN3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TMEM87AQ8NBN3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TMEM87AQ8NBN3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMEM87AQ8NBN3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMEM87AQ8NBN3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMEM87AQ8NBN3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMEM87AQ8NBN3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMEM87AQ8NBN3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMEM87AQ8NBN3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMEM87AQ8NBN3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMEM87AQ8NBN3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMEM87AQ8NBN3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMEM87AQ8NBN3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMEM87AQ8NBN3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMEM87AQ8NBN3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMEM87AQ8NBN3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMEM87AQ8NBN3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMEM87AQ8NBN3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TMEM87AQ8NBN3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMEM87AQ8NBN3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMEM87AQ8NBN3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMEM87AQ8NBN3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMEM87AQ8NBN3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMEM87AQ8NBN3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMEM87AQ8NBN3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMEM87AQ8NBN3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMEM87AQ8NBN3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
TMEM87AQ8NBN3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMEM87AQ8NBN3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMEM87AQ8NBN3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMEM87AQ8NBN3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMEM87AQ8NBN3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMEM87AQ8NBN3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMEM87AQ8NBN3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMEM87AQ8NBN3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMEM87AQ8NBN3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMEM87AQ8NBN3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMEM87AQ8NBN3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMEM87AQ8NBN3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMEM87AQ8NBN3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMEM87AQ8NBN3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms