Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NHLRC2Q8NBF2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NHLRC2Q8NBF2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NHLRC2Q8NBF2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NHLRC2Q8NBF2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NHLRC2Q8NBF2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NHLRC2Q8NBF2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLRC2Q8NBF2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLRC2Q8NBF2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NHLRC2Q8NBF2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NHLRC2Q8NBF2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NHLRC2Q8NBF2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NHLRC2Q8NBF2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NHLRC2Q8NBF2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLRC2Q8NBF2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLRC2Q8NBF2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLRC2Q8NBF2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NHLRC2Q8NBF2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NHLRC2Q8NBF2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NHLRC2Q8NBF2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NHLRC2Q8NBF2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NHLRC2Q8NBF2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NHLRC2Q8NBF2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NHLRC2Q8NBF2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NHLRC2Q8NBF2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NHLRC2Q8NBF2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NHLRC2Q8NBF2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NHLRC2Q8NBF2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms