Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms