Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SVBPQ8N300 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SVBPQ8N300 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SVBPQ8N300 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SVBPQ8N300 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SVBPQ8N300 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms