Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1A0

KRT222, Keratin-like protein KRT222, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT222Q8N1A0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT222Q8N1A0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT222Q8N1A0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT222Q8N1A0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT222Q8N1A0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT222Q8N1A0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT222Q8N1A0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT222Q8N1A0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT222Q8N1A0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT222Q8N1A0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT222Q8N1A0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT222Q8N1A0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT222Q8N1A0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT222Q8N1A0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT222Q8N1A0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT222Q8N1A0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT222Q8N1A0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT222Q8N1A0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT222Q8N1A0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT222Q8N1A0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT222Q8N1A0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT222Q8N1A0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT222Q8N1A0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT222Q8N1A0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT222Q8N1A0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT222Q8N1A0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT222Q8N1A0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT222Q8N1A0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT222Q8N1A0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT222Q8N1A0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT222Q8N1A0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT222Q8N1A0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT222Q8N1A0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT222Q8N1A0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT222Q8N1A0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT222Q8N1A0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT222Q8N1A0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT222Q8N1A0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT222Q8N1A0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT222Q8N1A0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT222Q8N1A0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT222Q8N1A0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT222Q8N1A0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT222Q8N1A0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT222Q8N1A0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT222Q8N1A0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT222Q8N1A0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT222Q8N1A0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT222Q8N1A0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT222Q8N1A0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT222Q8N1A0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT222Q8N1A0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT222Q8N1A0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT222Q8N1A0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT222Q8N1A0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT222Q8N1A0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT222Q8N1A0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT222Q8N1A0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT222Q8N1A0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT222Q8N1A0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT222Q8N1A0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT222Q8N1A0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT222Q8N1A0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT222Q8N1A0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT222Q8N1A0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT222Q8N1A0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT222Q8N1A0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT222Q8N1A0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT222Q8N1A0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT222Q8N1A0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT222Q8N1A0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT222Q8N1A0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT222Q8N1A0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT222Q8N1A0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT222Q8N1A0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT222Q8N1A0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT222Q8N1A0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT222Q8N1A0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT222Q8N1A0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT222Q8N1A0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT222Q8N1A0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT222Q8N1A0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT222Q8N1A0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT222Q8N1A0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT222Q8N1A0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KRT222Q8N1A0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT222Q8N1A0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT222Q8N1A0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT222Q8N1A0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT222Q8N1A0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT222Q8N1A0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT222Q8N1A0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT222Q8N1A0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT222Q8N1A0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT222Q8N1A0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT222Q8N1A0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT222Q8N1A0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT222Q8N1A0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT222Q8N1A0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT222Q8N1A0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms